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用MCScan做共线性分析时，准备allmRNAID.txt文件，发现有些转录本定位在了contig上，这些定位在contig上的转录本需要算进去吗？

  • 2023-05-24 00:55
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做MCScanX共线性分析提取不了蛋白序列文件

  • 2023-05-12 10:39
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下载gene family镜像总失败

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老师您好，请问蛋白序列有多个基因结构域，做系统发育树以哪个结构域为准呢

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老师您好，有多个结构域时，做系统发育树以哪个结构域为主呢？

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老师你好，我在再次搜索新建物种特异hmm模型时，显示segmentation fault，请问是怎么回事呢

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老师，麻烦您再帮忙看看下载镜像v2.0时出现了pulling fs layer，但是查找镜像时又显示有了2.0这个镜像，我下载成功了吗

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motif展示

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老师好，我在使用samtools进行染色体长度获取时出现了这种报错。此物种的gff3文件没有具体的染色体长度注释，以及使用基因组染色体的fasta文件进行统计的话数据很多，工作量很大，麻烦老师帮忙看看怎么解决这个问题。谢谢老师！

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亚细胞定位预测所用的序列是基因的蛋白序列还是这类家族的结构域部分的蛋白序列？如MAP基因家族中某个基因的蛋白序列，还是这个基因中MAP结构域的蛋白序列

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Ka Ks值异常？

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老师你好，我想问一下亚基因家族没有pfam号的话，使用blastall，那比对率要设置多少合适呢？

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50 求教老师，我在做大麦基因家族分析构建进化树时，拟南芥中的已知的成员和我大麦中鉴定出的成员分不到一起，拟南芥单独分了一支，没办法做比较，这种情况怎么解决呀

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60 求教各位老师，做大麦基因家族分析构建系统进化树时，拟南芥家族成员分到了单独一支，和大麦成员没法做比较。这种情况怎么解决呀

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3 在基因家族分析的课程里，提取结构域序列，WRKY基因家族当时以提取第一个结构域序列为例，两个结构域都是WRKY DNA -binding domain，为什么要提取第一个结构域呢，我想知道怎末确定自己要提取哪个结构域序列？希望老师解疑惑

  • : ) 2022-11-08 21:47
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hmm搜索失败，已检查hmm文件，并重新建hmm模型，还是报错。

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motif

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blast建库,DNA序列,all vs all 比对后输出文件0kb

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有几个不同品种的文件夹怎么进行基因鉴定？是单独鉴定还是合并呢？合并是要怎么合呢？

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关于基因结构分析失败的原因分析