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10 【MCScanX】 tandem文件中【串联重复】基因对，若其中一个基因A属于已鉴定基因家族，另一个基因B由于结构域不完全被剔除在外。请问在circos绘制串联重复图时，还要保留A基因吗？

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请问虚拟机进不去咋办

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老师您好，我做藻的基因家族分析，构建进化树的过程中遇到了mega软件比对NJ法不能够完全比对成功，显示总是有一次错误，进化树显示不完全，更换其他方法后，进化树也都显示不完全，请问这样的有什么解决办法嘛

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基因家族成员系统发育树

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3 建立进化树

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老师，我共线性出的图没红线，这是怎么回事啊

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3 建立进化树

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20 我使用OrthoMCL处理blast产生的结orthomclBlastParser blastresult compliantFasta > similarSequences.txt，出现了问题，不知道怎么解决

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5 鉴定同源基因的orthoMCL和OrthoFinder在结果上有什么区别嘛？谢谢各位老师啦~

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你好，家族分析时要求把序列和进化树上传到tree base数据库中，有上传过的吗？

  • we 2021-07-26 16:21
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无法下载MCScanX-transposed

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老师，我在做共线性的时候遇到下面的问题，该如何解决

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去冗余的同时，提取前两列的信息

  • lkl 2021-05-13 16:05
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请问下面这个蛋白质三级结构的 紫色的球状代表什么结构？？我研究的是家族 好多蛋白都没有这个结构

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老师，你好，我看基因家族分析那个课，找不到TBtools的安装包啊。网上找的没有您课件展示的提取motif分析结果的那个功能，麻烦您能再分享下您的TBtools的安装包吗？

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基因家族共线性分析的时候，水稻基因组按照脚本来还是查找不到想到了的 ，提取不出想要的序列

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求教PlantCARE网站 打不开，有别的网址吗

  • 2021-02-18 23:54
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各位老师好，我想问一下为什么这两个步骤结果对不上，第一个结果里面没有cds的信息。而第二个都是cds的序列。基因文件是在ncbi上下的

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5 求蛋白家族的进化聚类分析详细方案

  • 2021-02-01 00:03
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在基因家族分析的时候，结构域的筛选E-value值的时候，选取小于0.0001，运行命令，结果中并没有排除掉一些大于该值的序列，3.4e-05到底等于多少，是3.4乘以e的-5次方还是3.4e的10的-5次方