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基因家族共线性分析的时候，水稻基因组按照脚本来还是查找不到想到了的 ，提取不出想要的序列

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求教PlantCARE网站 打不开，有别的网址吗

  • 2021-02-18 23:54
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各位老师好，我想问一下为什么这两个步骤结果对不上，第一个结果里面没有cds的信息。而第二个都是cds的序列。基因文件是在ncbi上下的

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5 求蛋白家族的进化聚类分析详细方案

  • 2021-02-01 00:03
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在基因家族分析的时候，结构域的筛选E-value值的时候，选取小于0.0001，运行命令，结果中并没有排除掉一些大于该值的序列，3.4e-05到底等于多少，是3.4乘以e的-5次方还是3.4e的10的-5次方

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共线性分析得出的基因对可以用于kaks分析吗？还是只有串联重复的基因对才可以用于kaks分析啊？

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提取结构域序列

  • 荣 2020-11-28 15:33
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请问我用Evolview美化进化树时，为什么图片输出的不完整，有四百多条序列？

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请问大家在构建进化树的时候，发现分组与拟南芥中的不同，比如A4分组被分开了，请问有什么解决方法吗？谢谢

  • 2020-11-15 20:10
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动物基因顺势作用元件的预测

  • 2020-11-11 16:47
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问一下老师们，在用get_genefamily_bed.pl 这个脚本，提取自己基因家族位置信息的结果文件总是为空，下面是为的输入文件。perl get_genefamily_bed.pl -in1 SAT.IDlist.txt -in2 Oryza_sativa.IRGSP-1.0.47.gff3 -out MtN3_SAT.bed执行的是条命令。

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5 单个物种的单个基因的kaks怎么计算

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基因与mRNA的对应关系

  • Leo 2020-08-27 08:36
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基因组比对

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老师，您好。我想请问为什么我在NCBI搜某一基因mRNA和蛋白质序列，点击NM和NP他们属于不同家族呢？

  • 2020-05-11 13:24
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NJ法和ML法建树大大不同

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3 结构域建树

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内含子个数和外显子个数怎么通过out文件看出来啊

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请问老师NCBI和Pfam数据库查找基因家族保守结构域相关信息的问题。

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bio-linux中用hmmsearch遇到问题