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MCScanX报错

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老师您好，在用pfam号进行基因家族搜索时，一次搜索得到的基因数目比文献当中报道的数目要少。是不是二次搜索建立物种特异hhm后，搜索的基因数有可能会多一点呀？

  • yan 2020-03-24 02:00
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请问一下要做进化树分析，至少需要多少个家族成员，只有两个是不是不可行？

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老师，我做进化树美化的时候，想出现如下两个环这种该如何操作呢？

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基因家族clustw的问题

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老师您好，我想问一下虚拟机“ Bio-Linux-8.0.7”在启动期间意外退出，退出代码为1（0x1）该怎么解决？

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老师，您好，基因家族鉴定后的数目只有6个，所以我又鉴定了一些其他物种里的该基因一起构建进化树，这样可以吗？谢谢

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请问老师NCBI和Pfam数据库查找基因家族保守结构域相关信息的问题。

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请问已经建好的进化树，可以用Evolview改ID的名称吗

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老师，请问一下我这儿有三个HMM文件，我想一次性筛选出同时含有三个结构域的基因家族，不知怎么可以做到呢？

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老师我用这个脚本文件提取基因的注释信息，为什么只能提取出CDS的位置信息呢，其他如外显子位置信息提取不出来呢？如下图，请问老师这是什么一个原因呢？

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老师你好， 一般来说，用hmmer搜索出来的结果和 blast出来的结果，哪个比较好一点呀？

  • yan 2020-03-16 12:33
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bio-linux中用hmmsearch遇到问题

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小麦基因组Un不能做串联重复的话，做大片段重复和共线性分析可以吗？还是Un序列上的基因只能以同源基因来说明，谢谢老师

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请问老师我做了一个植物 基因原核表达到载体里验证功能 验证这个植物基因TPS家族的一些基因。

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10 基因ID、cds ID与蛋白ID三者均不一致

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请问老师，在用tbtools做进化树，基因结构，motif三者图时，出现进化树基因有43个，但是基因结构图和motif图基因数只有36个是撒原因？？

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5 基因家族分析绘制基因在染色体上的位置gene_chr.txt是空文件

1 解决

老师您好，咨询一下转录组和基因家族结合发文的问题

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做物种间共线性分析报错，请问哪位大神可以指点一下