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老师,想请教一下TCGA基因表达数据的问题,我从xena.ucsc网页上下载了基因表达数据TCGA-CESC.htseq_counts.tsv;然后发现该数据中只有Ensembl格式的基因ID ,没有SYMBOL格式的。所以接下来进行基因ID格式转换,却发现同一个SYMBOL ID对应的多个Ensembl格式的ID,想问下老师,这种情况该怎么处理?同一个SYMBOL ID所对应的多个Ensembl格式ID的基因表达数据应该留下哪一个?
生存分析
TCGA
基因表达数据下载
Bella
2021-10-25 16:15
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想问一下大家做蛋白质谱搜库分析的时候用maxquant我原始文件是wife.scan格式的不是raw格式的用此软件可以吗,因为看到在选项里面是有wiff的,但是我发现最后性能那里不能得到结果,显示报错,想问有没有大神可以解答一下呀多谢多谢
2021-01-03 19:03
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想问一下用做药物作用后的itraq标记质谱分析蛋白的变化?对照组是113和114,实验组是115,116,117,那如果得到了115/113,116/113,117/113,115/114,116/114,117/114这些都是实验组与对照组倍数变化fold change 以及他们对应的p值,那我怎么用,筛选的时候要用这六个比值的均值吗?还是有其他的筛选办法?还有六个p值应该如何来筛选?
2019-10-21 00:30
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蛋白组学差异蛋白的筛选
丑小
2019-04-16 16:51
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老师,通过蛋白保守相似序列分析,推测了葡萄园有孢汉逊酵母中与酿酒酵母相似的功能基因,并编号gxxxx.t1,请问老师,如何可以获得这条基因序列,NCBI中仅有葡萄园有孢汉逊酵母的全基因组信息,谢谢老师
1988我想和世界谈谈
2019-02-28 18:44
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做Itraq或TMT蛋白定量分析,植物叶片需要最少多少组织样品?
TMT
ITRAQ
蛋白质组学
2018-09-06 13:03
1
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想做蛋白组实验,请教下iTRAQ/TMT和label free的区别:
2018-09-04 11:43
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所研究的物种没有全基因组序列,能否做蛋白质组学分析呢?
蛋白质组学
ITRAQ
TMT
生信老顽童
2018-08-02 17:30
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做iTRAQ/TMT蛋白组学定量分析,不同老师的样本可否放在一组上机?
蛋白质组学
ITRAQ
TMT
生信老顽童
2018-07-27 10:44
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Itraq和TMT的区别?
蛋白质组学
ITRAQ
TMT
生信老顽童
2018-07-27 10:42
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蛋白质组测序过程中搭桥是什么意思?
实验设计
2018-07-25 20:47
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解决
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蛋白质组学文章中差异倍数选择相差很大,有没有一个标准?
蛋白质组学
生信老顽童
2018-07-24 15:42
1
解决
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5
蛋白组组学分析中:iTRAQ/TMT与Label free的优缺点
蛋白组组学
生信老顽童
2018-07-16 10:32
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