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单细胞测序FindAllmarkers

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eggNOG 保留蛋白序列时提示同一 ID 被多个一级特征使用，而子特征的 Parent 属性没有得到相应更新，导致注释关系不明确的问题，该怎么解决

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10 cellchat的netVisual_bubble

  • 2025-03-08 01:40
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转录组mfuzz分析问题

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RNAseq有参转录组分析差异表达分析免疫亚型之间差异表达这一环节出现以下问题

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RNAseq有参转录组分析差异表达分析这一环节出现一些问题，ggplot版本问题

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RNA-SEQ有参转录组的课程，可以来分析全转录组数据吗

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docker search 出现错误是怎么回事

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拟时序分析分化方向和实际不相符合

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3 在进行转录组分析时，在自己的服务器上怎么使用以下命令，请老师帮忙解答；（没有root权限，docker镜像用不了，想在外部自己的服务器中使用）

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SoupX去除污染RNA

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KEGG富集分析

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有关于GSEA富集分析参数设置

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5 could not find function "newCountDataSet"运行deseq_analysis.r这个脚本报错

  • 荣 2024-12-12 16:45
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lncRNA测序，如何把四种RNA分离，或者只提取mRNA

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5 想请问安捷伦双通道芯片数据得到了cy5和cy3通道的数据，想要做一些其它的分析，请问可以单独提取cy5的数据吗？然后对cy5中的数据重新进行别的分析？比如细胞类型反卷积之类的

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infercnv error in readrds(reload_info$expected_file_names[[i]]) : error reading from connection calls: <anonymous> -> readrds execution halted

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找不到课程对应的代码文件

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20 用enrichGSEA和用官方GSEA软件跑出的多条通路都是相反的，是为什么呢

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10 您好，请问20240627这个程序里，如何能merge后进行meta date分组呢？