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老师,我用mapman对非模式作物进行基因通路注释,通过esembl biomart获得每个基因氨基酸序列,然后去官网制作mapping文件,在mapman软件进行注释,过程没有出现问题,也出了图,但是我点开某一通路,想看看有哪些基因的时候,我发现底下的基因注释与图中位置是不一致的,例如图中的ABA、JA,底下的Binname应该是和他们没有关系的吧?请问这是怎么回事
Mapman
mapman 转录组
麦田里的稻草人
2020-07-29 10:38
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老师您好,知道拟南芥基因家族名称,也知道成员的基因名,怎样找到成员基因序列?谢谢老师
郭梦真
2020-07-27 21:11
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用gffread将gtf转化为fasta报错
RNA-seq
ST
2020-07-21 16:13
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基因组的SNP与转录组的SNP的区别,以及各自的优势
kuku93
2020-07-21 09:02
1
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老师,你好!做完基因家族生信分析后,要做验证验证实验的话,一般可以从哪些方面入手么?
在路上
2020-07-17 09:43
1
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请问我跑一个perl脚本,怎么限定它在服务器的线程呢?因为没有限定线程服务器好响啊,之前有些脚本会提前用-T指定线程,可是这个脚本是我自己写的,突然不知道怎么限定线程了,谷歌没找到答案,求救于此
Xzq
2020-07-09 14:26
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老师,您好!根据您得帖子,我在BinGO分析做GOmaping时还是不能完成,希望可以得到您得指导!十分感谢您!
WRN
2020-07-05 18:43
1
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2026
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老师,您好!根据您得帖子,我在BinGO分析做GOmaping时还是不能完成,希望可以得到您得指导!十分感谢您!
WRN
2020-07-05 17:48
1
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请问老师转录组测序结果中的log2(fold change)值具体计算步骤是怎样的?
差异倍数
fold change
Jenny
2020-07-04 20:25
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老师,你好!请问一下可以用 “荧光定量的数据” (多个基因在不同组织的定量数据)做热图么?做成柱形图数据有点多!
heatmap
在路上
2020-07-03 11:42
1
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转录组测序
GC含量
2020-07-03 11:26
1
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3942
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基因序列获取 老师,你好!在查找文献时,查到了想要的拟南芥基因ID,用什么方法可以获取对应ID的蛋白序列呢
在路上
2020-07-01 17:24
0
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mapman的mapping文件
Mapman
载体蛋白
2020-06-30 20:32
2
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请问你们生信的软件一般在哪里下载的呢?mybiosoftware有些软件下载不了,求R8S软件的包,以及教程
Xzq
2020-06-29 19:44
1
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3248
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pheatmap做cutree,分成了4组,怎样知道每组中都有谁,每组有多少个基因呢?我数据量比较大,不能全部显示
pheatmap
R
小背包
2020-06-27 20:33
2
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4248
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RNAseq有参转录组数据自主分析课程,在建立基因组索引的时候出现如下问题
RNA-seq
zhanggavin2015
2020-06-26 13:43
1
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老师你好,解压编译好的软件在执行时提示说:无法执行二进制文件,这是怎么回事我又该如何解决呢?
Xzq
2020-06-26 13:01
2
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果实发育时期的转录组热图中,有几个基因在各个时期均表现低FPKM值,请问是转录组数据有误吗?
表达量 热图
基因家族分析
转录组
JNDASJDL
2020-06-22 17:31
0
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mapman里边如何确定要研究的通路?例如我想看内质网中的蛋白质加工,但是mapman里边没有,这要怎么办????蟹蟹
LU XIU PING
2020-06-22 08:44
0
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mapman里边如何确定要研究的通路?例如我想看内质网中的蛋白质加工,但是mapman里边没有,这要怎么办????蟹蟹
LU XIU PING
2020-06-22 08:44
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