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GFF文件解释

  • 2019-10-25 11:06
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老师您好，我有个问题想请教您，就是以您看的文献来说，您觉得有转录因子调控CDPK激酶的文献，就是说转录因子可以和CDPK激酶的启动子结合的例子吗？因为我用某个CDPK酵母双杂交筛到了一个转录因子，现在不确定到底是这个转录因子结合了CDPK的启动子，还是这个CDPK激酶对这个转录因子磷酸化，对于它们的上下游关系我还不是太明白，是不是用CDPK筛到的转录因子就说明了什么关系呢它们之间

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请问如何根据已有转录组预测转录因子的靶基因？

  • 2019-10-23 18:21
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转录组中count值为什么要经过标准化，计算FPKM值来表示表达量？

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转录组数据里的count值是指什么？

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转录组差异分析里GO注释的图怎么看的？

  • 2019-10-21 11:04
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老师您好，我想问一下在做基因家族成员在植物各个组织器官中的表达量时（qPCR），一般是以哪一个器官为对照呢？是随意选的吗?我看有的文献是以根，有的是以茎的为对照，这是如何确定的呢

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我想参加10月北京转录组的培训，我是吉林农业大学的学生，咨询你们说没有长春的培训计划，请问外地去培训能不能给些优惠?比如打折或者联系便宜点的住宿

  • DC 2019-10-15 10:11
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差异基因数量太多，通过GO富集分析筛选一部分，再进行蛋白互作，可行吗？

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cytoscape绘图问题

1 解决

20 无参转录组使用kobas进行KEGG分析的时候，应该选择什么物种？

  • 2019-10-10 17:57
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请问GO富集文件gene2go和go2gene之间怎么转换？

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老师好，我想问一下，RSEM、FPKM和TPM是一个什么样的关系呢？reads count又有怎样的用途，与前面三个有关系吗？有一篇paper中说，The RNA-Seq by Expectation–Maximization (RSEM) expression values were used for statistical analysis.这是说统计学分析需要用RSEM标准化处理后才能进行吗？

  • QQ 2019-10-04 10:44
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无参转录组怎么分析？

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GO层级整理

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无参转录组比对达到多少。认可为相应基因？

  • yc 2019-09-28 16:07
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您好，我在数据库中搜索到了某个物种基因组测序的SRA序列，但没有注释。请问，我可以把它下载下来，就某一个基因家族序列进行注释吗？

  • yc 2019-09-28 16:06
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Trimmomatic软件可不可以去除hiseq4000的接头

  • 2019-09-28 14:42
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老师，你好。在做有参转录组分析，转录本基因表达量出来之后，发现里面找不到我期待的同源基因（ID)，不过里面发现了好多MSTRG.这样的ID，问题是这些ID在我的注释文件里根本没有，详细情况如下

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10 大佬们，想咨询个问题，如何从公司测回来的转录组数据找出自己想要的某个功能的差异基因呀？

  • 2019-09-26 14:19