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5 用无参转录组做基因家族分析

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老师，请教您一个关于RNAseq数据分析的问题，如果我有1个对照组、3-5个实验组（每个实验组有两个重复），我可以对1-5组一起进行RNA-seq差异基因表达分析吗？可以用什么方法呢？ 我目前只接触过两组间（1个对照组、1个实验组）基因表达数据的差异分析，未接触过多个实验组数据的分析，所以想请教下老师，希望得到您的帮助，先谢谢您啦！

  • 荣 2022-05-22 14:53
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200条蛋白构建进化树后，evolview等美化软件均无法显示boot值?

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有没有人知道电脑运行内存不够怎么跑数据啊？

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你好，进化树网站现在打不开啊，麻烦您能推荐下别的在线工具吗？

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老师，qiime2 data2运行出错，错误信息如图，请问是电脑运行内存不够么？还是其他原因导致的？求解决方案

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老师，您好，请问我的基因组下载不了GTF文件，有的是gff3文件，文件如下，不知道是否可以拿来尽力索引？

  • 2022-05-15 09:42
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fastqc质控时报错，提示Ran out of data in the middle of a fastq entry.是什么问题？

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我购买了引物设计的课程，关注公众号回复关键词后没有反应是什么原因

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老师，我在水稻转录因子文库中筛选出来了一些转录因子，我想预测一下它的下游靶基因，并制作一张调控网络图，不知道如何下手，我买了组学大课堂的那个转录组的课程，但是还是不咋懂，希望老师能帮助一下我，谢谢！

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蛋白质ID如何转换为Gene的ID

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关于RNAseq的docker分析中获取基因长度报错问题

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使用hisat2比对时结果出错

  • 2022-04-21 09:48
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请问下会从三代测序的bam文件中提取想要序列的bam文件吗？

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我按照链接文档安装，但是都失败了。我用我同学的电脑安装一次就成功了。想知道我电脑为什么安装不了的原因。

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sam 转换成bam 格式并排序时，没转换成功。reads 与基因组进行比对map这里出错。

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我是win10家庭版，由于没有Hyper-V所以要先设置一下，但是我在以管理员身份运行Hyper-V文件时，总是会卡在这，一直不变，也没有进度条什么的，试了好几次了，都是这样。

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老师，您好，我的电脑是企业版，但是找不到hyper-v，在dism中找到的好像运行过hyper-v但是后面就被关掉了，在程序与功能中找不到hyper-v，这是为什么呢

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转录组自主分析map出现问题

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老师您好！我要进行小麦基因蛋白互作网络分析，使用小麦与拟南芥找到8对同源基因，后来用Cytoscape进行美化时，要用所找到拟南芥映射小麦，这个映射用VLOOKUP比对时是用的之前找到的8对同源基因即下载的ortho-orthologs文件吗？