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差异基因表达多组样本分析—— 老师 这个命令可以讲解一下是什么意思吗 以及多个分组应该在哪个位置输入啊

  • lw 2024-07-29 19:09
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老师您好，我在参考基因组建立索引时，系统报错说有1700个基因区域没有ORF，但是我的参考基因组和注释文件都是从文献链接里下载的，不知是否会影响我的后续关于群体进化的分析呢？

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cnvpytor 不运行

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老师，我的结构域搜出来全都是这种不显示我的家族GASA这种字母的，是不是就说明我的这个结构域不存在？

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number of analyzed snp 与 number of total SNPs/有什么区别

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我按照视频里的方法用deblur的方法进行分析，输入了51个样本，但是最后就剩下了35个样本，如图所示，请问是那一步出现错误了，是 数据有问题还是写的参数有问题

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老师您好，用tassal跑出的曼哈顿图没有数据点，但qq图正常，gemma也一样是什么原因？还有var.txt 大小为0是怎么回事

  • WHR 2024-06-27 09:32
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基因家族两个结构域

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泛基因家族分析分析 pav中统计样本数量

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要进行单倍型分析，但是镜像不是搭建在2.0版本了，docker pull下载不了，联系客服拿到安装包之后一直报错，解决了一天了也没解决问题，求解求帮助

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想请教一下，我是基于windows+docker做的宏基因组注释，然后在去宿主这一步，卡住了 不知道为啥 一直不动

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使用fq文件去重脚本出现问题

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SRA数据下载

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03.PAV 提取物种独有的家族基因时，出现killed ，不能进行代码操作

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老师您好，为什么在gwas最后的筛选关联区域SNP信息时，总报错错误信息如下，总是被杀掉，vcf文件应该是没有错的，截图如下，输入文件如下，请您帮忙查看，我该怎么修改我的命令

  • WHR 2024-08-04 18:46
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基因家族数据准备

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泛基因家族 提取CDS序列和pep序列 跑了很久之后，显示没有权限

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进入容器以后是这个样子，怎么办

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xpclr 软件不能运行

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估算物种分化时间