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老师，我有141个样品，现在IndexFeatureFile，tabix，bcftools都无法成功构建gvcf的索引，只有CSI格式能成功索引，这个格式在后续也用不了，这个gvcf索引还有其他的解决办法嘛，还是说我只能重新生成vcf文件了

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hmmsearch 关于参数--cut_tc设置

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3 关于泛基因组的pangene.list

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请问，我弄了一个256线程，1t内存的服务器，想处理500G的宏基因组注释，大概需要跑多少天，全套下来

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安装本地docker出现错误

  • 李 2024-10-29 12:58
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FASTA文件如何查找，以及模板是什么样的

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做16S和非靶代谢的组学，样本组数太少可以直接补充吗

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有关于GSEA富集分析参数设置

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为什么vcf文件根据不同参数过滤后保留163138个位点但最终LM和LMM进行关联时却只有102296个snp位点？

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SNP数据统计

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07.SV_and_gene_expression中删除一些不需要的基因的表达量后文件是空的

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老师，我的db文件夹里显示了所有染色体都已经导入，但是在将gvcf转换成vcf时，发现在Lc2Ns染色体就结束完成了，这是正常现象嘛，是我使用的近源种参考基因组的原因嘛？我的是简化基因组测序的

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老师 我的问题能解决吗 一个月啦 说的方法我也做啦 还是没有解决 ，，回复的你测序仪是华大测序仪 已经一个星期啦 还是一点音信都没有

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老师，就是我把重测序个体分为三组进行SNP扫描，然后把三次扫描的结果进行合并，得到最后的扫描结果，可以这样操作吗，，下面是代码， 或者是有没有可以将其分开进行snp扫描 然后合并的其他方法，还请老师认真帮我解答 谢谢

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物种注释出现killed,我调了参数还是出现这个问题，除了用台式机或者服务器之外还有别的办法吗？

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老师，麻烦您解答一下

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老师，您能给找找这几种杜鹃的genome.fasta和gff3文件吗，我找到的文件在提取cds和pep的时候，一直是错误的。

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3 我按照视频里的方法用deblur的方法进行分析，输入了51个样本，但是最后就剩下了35个样本，如图所示，请问是那一步出现错误了，是 数据有问题还是写的参数有问题

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Doker打不开，显示内存不够，电脑还有100G内存: don't have enough memory

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泛基因家族mkdir文件夹显示已存在，但目录里没有任何内容