1 回答

GATK 将VCF文件导入db出现问题

1 回答

老师您好，进行比较基因组分析时候，单拷贝直系同源群为0，后续的分析就出现了报错，这是什么原因，是我选择的基因组不合适还是其他原因。

2 回答

保留蛋白编码基因运行就这样，不能回到docker ，怎么解决？

0 回答

您好老师，我想咨询一下plink 软件core dumped报错

1 回答

blsatp，我想拿发表文献的基因ID的蛋白序列和我自己搜出来的序列（$species.gene.pep.fasta）比对。我先是把这两个序列放在一起。然后再建库比对。出现问题。怎么办？后来我在那个gene.pepe.fasta中选择几个序列和发表文献的序列放在一起建库比对就能行。原因是什么？我

1 回答

docker加载镜像报错

1 回答

老师，我要做泛基因家族分析中泛基因列表构建，我是不是只需要把data数据的基因组和gff文件链接过去，不用再建文件夹下载了，然后一步步做Rstudio的操作么，我需要下载pangenlist里面的哪些文件到自己的服务器？

1 解决

蛋白3D结构预测

0 回答

你好，

1 回答

用ALLHIC挂载时，划分Group出现问题

0 回答

老师，我研究的植物有人已经构建了泛基因组，用的从头组装比对的方式，我想问一下，如何利用他的数据做我的研究，我可以添加几个自己的物种进去吗，请老师给个研究思路

  • Oho 2025-03-27 10:25
1 回答

我让生物公司测一个莱甲的基因组，挂载的时候他们挂载6条染色体，但是我核型检测是13对染色体，挂13个的hic热图效果不如挂6个的图好，这种情况怎么处理呢

  • Nier 2025-09-07 10:21
1 回答

老师，您好！请问做全基因组选择（GS选择）之前，训练集和预测集的划分，有没有代码可以按照特定比例，随机快速实现材料的划分，并生成文件？（比如20%个体作为训练集，80%个体作为预测集；40%个体作为训练集，60%个体作为预测集；60%个体作为训练集，40%个体作为预测集；80%个体作为训练集，20%个体作为预测集，等等）

  • 2025-08-08 16:14
2 回答

老师您好，进行比较基因组分析时候，在第一步数据处理，保留编码蛋白基因，及最长转录本时，出现报错，这个对后续分析有影响嘛

2 回答

老师，这是我做出来的PAV热图，每个基因都是物种独有的，这个PAV热图效果是不是不好，这个PHY家族是否合适继续研究，没办法做聚类分析这些了

1 回答

老师你好，我用全长序列进行比对构建进化树时，发现许多序列的长度长短不一，这样可以用吗？ 感谢老师答疑

  • 2025-04-03 10:41
0 回答

老师，这个筛选步骤每个基因组只有一个基因，后面提取可靠基因家族成员的蛋白全长序列正常，提取可靠基因家族成员的结构域序列这一步也是只有一个，是我前面的步骤出错了么，筛选前还一切正常，

1 回答

老师，这是我的gene.list和其他文件的基因，不是只有一个，而且也能对上，但是做domaindomain_final.bed的时候就只有一个基因，我试了WRKY和FAE1这两个家族，都会出现这种情况

0 回答

卸载重装后docker后为啥docker pull omicsclass/organelle-assembly:v1.0怎么下载不了这个镜像了

1 回答

根据组装后基因做的物种注释，还需要做稀疏曲线吗