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基因型文件里面包含了snp和indel，怎么Indel和表型进行关联分析，是需要把vcf文件转换一下格式嘛，具体代码是什么，期待老师的解答

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重测序

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并行运行

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重测序 htop 查看服务器使用

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老师就是做到xpclr和TajimaD的时候 出现下面的错误 要怎么解决呀

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并行运行

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这个脚本如果直接从ensamble下载cds和pep还需要去提取吗，是不是可以直接转换格式

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dadi

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大家好啊，新手一枚，请多关照哈

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老师您好，单倍型分析的图是这样的，我关注的是蓝色框起来的标记，这个snp是否处于一个高度连锁的区域，属于左边的block还是右边的block呢

  • 2024-12-08 23:43
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老师 就是在做种群动态历史那里 我截频红色箭头指出的那个bam文件，是把所有的bam文件合并在一起的吗 还是什么意思呀。

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基因组数据的下载

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老师您好，单倍型分析的图是这样的，我关注的是蓝色框起来的标记，这个snp处于一个高度连锁的区域吗，属于左边的block还是右边的block呢

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R包在安装BiocManager::install("biostrings")出错

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请问跟着教程做的时候，无法下载omicsclass/reseq:v1.1，老师您能提供一份在线下载链接吗？

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老师，我在做饭基因家族分析，我搜集的基因组的gff3文件，第一列有的是chr有的是基因id，这个会影响后续结果嘛？

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XP-EHH

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这怎么添加ID或者是不是我下的文件的问题，那种文件是有ID的

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泛基因组 eggNOG得不到结果

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xpclr计算