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基因家族分析

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在基因家族分析中的顺势作用元件分析中有几个差不多的元件是不是一个元件

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老师，在泛基因家族分析，我提取最长转录本时输出的gff文件是空的，能帮我看一下为什么吗

  • aa1 2025-01-06 09:35
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遗传图谱分析课程

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ggtree.r进化树问题

  • BJFU 2024-12-30 08:43
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W11系统开启hyper-V失败

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老师 就是我在做基因流哪里的时候 出现啦下面的问题 需要怎么解决呀

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您好，想和您咨询一下，我用土壤样本测微生物宏基因组注释，40个样本，一共500g左右，想和您咨询一下，一定要用服务器吗，普通电脑96g运行内存有可能注释出来吗，感谢感谢

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ka/ks分析，有的基因没有axt文件

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老师，就是我在做结构变异分析那里，我重测序分析的个体只有36个 下面我用红色箭头指的那个参数和值为30的这两个参数设置为多少比较合适呀，谢谢老师

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3 基因家族分析 kaks分析

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gff3_file_to_proteins.pl 报错

  • Dg 2025-01-14 22:00
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老师，在使用gemma模型的时候，报这个错是为什么呀

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老师您好，我手上有一个基因的基因序列，通过pfam知道了它属于哪个基因家族，但是没有找到有做过这个基因家族的生信基因家族分析鉴定的文章，请问这种情况下能做基因家族分析吗？该怎么进行呢？

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如何删除01.data prepare呢？

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ls ../data/*.fa. |sed -e "s/.fa.//g" -e "s#../data/##g" > ../id.txt执行这条命令的时候，未能得到id.txt文件；2.想问一下：每次关掉putty的时候，都需要重新dockers run进入吗？3.软连接之后发现01.data prepare里面有玉米的数据了如何删除此01.data prepare？4.现在发现需要上传id.txt文件，将11个样本名输到txt文件里面，通过filezilla上传到data，再进行docker run？

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treemix

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5 请问利用jcvi整理泛基因列表，做JCVI做共线性分析时，一直提示/bin/bash: lastdb: command not found，是没有安装Last软件包吗？目前使用的镜像是购买课程时老师提供的，数据是26个玉米基因组数据（由于空间不足，只用了19个基因组）

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老师 就是 我在过滤数据的时候 下面截屏中利用vcfutils.pl进行过滤的时候 生成的文件还有7.2 Gb,但是用vcftools进行过滤后还剩764Mb的文件，这个是不是过滤掉的太多啦呀 麻烦您重新帮我设置一个过滤参数嘛 谢谢我重测序的个体才36个

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修改样本名称