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基因组注释数据库解压失败

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基因家族鉴定

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5 老师您好，我使用P-value进行转录组差异基因筛选，被审稿人质疑了，我看到您之前回复2020年的帖子说校正后p值筛选差异基因较少时用P-value也行，这种情况得后期用qpcr验证我数据是准确的是吗，我之前做了qpcr验证，但是用的不是我关注的差异基因，现在也不能补关注基因的定量了。我准备找几篇使用未校正p值的文章加上我之前做的qpcr来解释我的分析是可行的，您觉得这样可以吗？

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jcvi报错'LayoutLine' object has no attribute 'sizes'

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老师您好，我在参考基因组建立索引时，系统报错说有1700个基因区域没有ORF，但是我的参考基因组和注释文件都是从文献链接里下载的，不知是否会影响我的后续关于群体进化的分析呢？

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老师，HGMD链接失效了，可以再分享一下HGMD数据库的信息吗？

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TBtools报错

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HiC-Pro使用

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Error response from daemon: Get "https://index.docker.io/v1/search?q=omicsclass&n=25": unable to connect to 199.59.149.205:443. Do you need an HTTP proxy?

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putty 跑保留最长转录本，跑了一两个小时后突然没反应了，出现inactive

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关于代谢组学的原始文件处理

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老师 就是在计较基因组学哪里 请问一下下面这些物种的这些物种怎么下载它的genome.fasta和gff3啊 我在ensemble plant和jgi上都没找到，而且在ncbi上找到下载啦 打不开，，这种要怎么解决啊，

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RepeatMasker输出没有.divsum文件

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提取CDS序列时，任务被killed

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群体结构分析时，执行代码报错

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number of analyzed snp 与 number of total SNPs/有什么区别

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5 ###16S/18S 方法1：dada2 数据质量过滤，合并，去嵌合，去引物一步完成。这个步骤代码报错，请老师帮我看一下这个问题，之前有帖子也有这个问题，说是建议下载咱们课程提供的docker镜像，我就是下载的咱们课程的docker镜像，但还是出现了这个问题，请老师解答，谢谢！

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hmmer搜索结构域

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T2T基因组组装与注释17步

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请问这是怎么情况呀？