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老师,您好,我在运行gatk的HaplotypeCaller时,因为样本过多(二三百个样本),运行成功的单个样本运行了24+个小时,尝试了采用ParaFly工具多任务并行,并且也尝试了同时运行多个nohup sh gatk.g.sh > gatk.g.sh.o&(一个gatk.g.sh对应一个样本),但是都是在十几分钟后终止进程了,查看了其中一个gatk.g.sh.o文件,文件内容如下,烦请老师帮忙提出问题及解决方法,非常感谢
GATK call SNP
Evening
2024-10-21 15:59
1
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GSDS展示图中想修改下基因名称
御坂妹110
2024-09-12 10:54
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提取可靠基因家族成员的结构域序列
树心台
2024-09-14 11:03
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R 包 arrow 安装报错:arrow install error view_ = string_array_->GetView(i);
omicsgene
2024-09-05 18:14
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问题1:这是我按照咱们视频里的方法做的Lefse,但它没有上面的小写英文字母,a,b,c,d,等的图例,请问如何添加呢,我看发表的文章中都是有图例的,如何改成第二张图这样呢,右上角标有细菌名字的图例。问题2:第三图中有other,请问这个直接在特征标里面更改吗,删掉注释为other的,这样可以吗,请老师解答,谢谢!
zhangzhang
2024-09-25 22:45
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生物信息学入门看点啥
2024-08-31 15:48
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cafe5#基因家族总数#这一步报错
string11
2024-09-04 22:18
2
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比较基因组学03.Phylo_Tree/aln_out
Song
2024-10-03 11:27
1
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MCScanX没有结果怎么用circos作图
贰大大
2024-09-16 00:44
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基因家族数据准备
御坂妹110
2024-08-16 21:42
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做基因在染色体定位时,出现了问题
御坂妹110
2024-08-26 10:50
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为什么vcf文件根据不同参数过滤后保留163138个位点但最终LM和LMM进行关联时却只有102296个snp位点?
林烨奇怪怪。
2024-08-20 17:50
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打开docker,出现下面这种情况。但是已经安装了WSL
docker
wsl
camellia
2024-09-22 19:33
0
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T2T基因组组装和注释18步
宁静致远
2024-08-18 19:15
0
回答
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浏览
扩增子分析结果的差异显著性的p值在哪里找到
九夏微凉
2024-08-14 16:15
1
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请问老师这个LDA图中的other为什莫会出现呢,如何去除,直接在图里截掉,这样可不可以呢
zhangzhang
2024-10-13 11:32
1
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各位老师 您好 就是我知道啦组装基因组的gap还有端粒和着丝粒的位置和长度 我怎么将他们可视化在染色体上呀,就像下图一样。
烟雨易冷
2024-09-20 15:37
0
回答
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泛基因家族绘制热图报错
Orange_flame
2024-09-02 14:35
0
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SNP数据统计
叶雪儿
2024-08-18 23:47
1
回答
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omicsclass/rnaseq:1.0老师能分享一下吗?好像下载不了了
docker
Davie
2024-09-25 12:32
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