1 回答

老师，我现在在学习泛基因组分析，研究物种是梨；现已找到13个基因组，那我在基因家族鉴定的时候用13个基因组；而泛基因集的构建我需要选择几个？

1 回答

老师，我想做一下分子方差分析AMOVA，咱们有相关的代码嘛，好多群体遗传文献里有这个分析，不知道咱们可以提供嘛？

1 回答

泛基因家族成员选择压力分析中，构建的热图，很奇怪，我需要如何更改？

2 回答

请问老师单倍型分析结果中，我怎样确定block区间，如下图。请老师解答哪些标记划分为block1，哪些标记划为block2

  • 2025-02-23 21:38
1 回答

老师，构建泛基因列表使用的vcf文件，是下面图中的sv数据吗，下面表格包括了CHROM，POS，REF，ALT，TYPE，MAF,MIS，ANN，将这些数据整理成vcf吗？

0 回答

eggNOG 保留蛋白序列时提示同一 ID 被多个一级特征使用，而子特征的 Parent 属性没有得到相应更新，导致注释关系不明确的问题，该怎么解决

3 回答

重测序分析

0 回答

老师，想用ka/ks值画一个热图，而不是筛选大于1的基因做热图，请问如何修改代码及脚本？

0 回答

我用Evolview做了一个进化树加热图的图，我怎么把图例里面的白色对应刻度0啊

  • 2025-02-10 22:30
2 回答

老师，在泛基因列表构建时，总共113个基因组，成功提取了最长转录本，提取bed文件，但提取cds文件时，有一个文件A10总是失败，不知道什么原因。

1 回答

3 GWAS 曼哈顿 Manhattan 图像问题

  • John 2025-03-11 11:30
0 回答

老师您好，有两个基因家族的PFAM号是一样的，是不是代表可以归类为一个基因家族

1 回答

老师，进行结构变异分析时得到了tsv数据，请问需要转变为vcf文件吗？如果需要的话如何转变呢？

3 回答

20 从https://ricerc.sicau.edu.cn/下载的基因组和gff文件进行水稻泛基因分析，无法获取longest_isoform.gff3文件

2 回答

请问这个是中间文件吗，注释成功后，就可以删除掉，节约空间，是吗？

1 回答

[main] unrecognized preset 'china-wild-ibex-clean.recode.vcf.gz'

0 回答

5 老师这条代码里面INV[0-9]、DUP[0-9]， 0-9是什么意思，输出文件中INV后面跟着的数字代表什么

  • Oho 2025-03-11 19:40
0 回答

为啥我搜不到镜像啊

0 回答

二代DNA测序数据进行kmer分析，结果如下图，想请问可能的原因和建议。

1 回答

泛基因，运行代码时出现错误