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老师您好，在参考基因组比对时出错。

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老师您好，我在参考基因组比对的时候出现报错

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老师，我有20个不同菌株的基因序列（fasta文件），请问怎么进行基因组学分析？

  • 2025-02-23 13:46
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3 GWAS分析后选择关联区域（基因）

  • John 2025-03-11 17:01
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采用你们课程的：Rscript $scriptdir/gwas_manhattan_plot.r 以及Rscript $scriptdir/qq_plot.r制作Manhattan图和QQ图后，Manhattan图最高的SNP仅仅显示半圆（如下图），请问如何修复（就是修改可视化Manhattan图的纵坐标）

  • John 2025-03-12 15:35
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老师我在构建泛基因列表，合成last.txt文件，结果只有两列

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想请教一下 cds.TEM 数据 ，然后也得到了cds里的名和KO0001表对应好的eggNOG里的表。想变成 KO0001-样本 的丰度数据表，应该怎么操作，合并KO0001的丰度？

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RNAseq有参转录组分析差异表达分析免疫亚型之间差异表达这一环节出现以下问题

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绘制核心基因和可变基因饱和曲线时提示错，检查文件没有问题。

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您好老师，我想咨询一下plink 软件core dumped报错

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泛基因家族，典型基因和非典型基因的热图怎么做？

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3 GWAS分析程序问题

  • John 2025-03-11 09:17
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老师 请问这个运行时需要很久吗，上面显示的需要7天

  • Oho 2025-03-08 15:13
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GO富集分析气泡图怎么画

  • lw 2025-03-02 17:25
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老师，请问分析fasta格式的文件需要全部转成gff格式再分析吗？

  • 2025-02-26 23:00
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老师您好，分析SNP和INDEL时报错，请解答。

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您好老师，我想咨询一下plink 软件core dumped报错

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宏基因组基因定量salmon

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老师您好，我的重测序数据在NCBI上按照（双端下载是这样：https://www.omicsclass.com/article/1703）这个教程下载的，但是在做数据质控的时候总是报错，以下是数据，您看看哪儿存在问题。

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在docker中用cleandata与宿主序列比对得到sam文件这一步出现错误，