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老师您好，我的重测序数据在NCBI上按照（双端下载是这样：https://www.omicsclass.com/article/1703）这个教程下载的，但是在做数据质控的时候总是报错，以下是数据，您看看哪儿存在问题。

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重测序分析

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绘制核心基因和可变基因饱和曲线时提示错，检查文件没有问题。

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数据质控出现报错

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老师，构建泛基因列表使用的vcf文件，是下面图中的sv数据吗，下面表格包括了CHROM，POS，REF，ALT，TYPE，MAF,MIS，ANN，将这些数据整理成vcf吗？

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请问这个是中间文件吗，注释成功后，就可以删除掉，节约空间，是吗？

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组装后的cds.fa文件进行Kegg注释

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老师，我在做泛基因列表时，提取最长转录本都成功提取，但其中一个基因组一直无法提取cds，后来查看提取出的转录本格式一样，但有些内容可能与其他基因组不一样（下载数据时，这个基因组格式是gff3，其他为gff，提取最长转录本时我把他改为了gff），您那边是否可以帮忙修改这个基因组的gff文件，

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您好老师，我想咨询一下plink 软件core dumped报错

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您好老师，我想咨询一下plink 软件core dumped报错

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老师，请问分析fasta格式的文件需要全部转成gff格式再分析吗？

  • 2025-02-26 23:00
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如何下载别人的重测序数据

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3 docker 安装

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请问可以同时运行2个terminal吗，在内存和存储还有cpu都有剩余很多的情况下

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老师，在泛基因列表构建时，总共113个基因组，成功提取了最长转录本，提取bed文件，但提取cds文件时，有一个文件A10总是失败，不知道什么原因。

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3 基因家族分析 kaks分析

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为啥我搜不到镜像啊

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使用lordec 利用二代数据校正三代数据

  • yy 2025-02-26 10:53
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RNA-SEQ有参转录组的课程，可以来分析全转录组数据吗

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基因结构注释效果不理想