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基因家族分析之基因结构分析

  • 荣 2025-04-16 23:03
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20 GFF文件格式不标准

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泛基因家族鉴定-找不到Bio::SeqIO模块

  • Q_C 2025-04-16 13:28
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宏基因组数据预处理问题

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windows10安装docker后，输入命令，报错，请问如何解决？

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代谢组数据正态检验

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老师上课的内容，为什么我的demo里面没有东西？

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基因家族生信

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文献给的下载基因组网站下载不了花生基因组数据，ensemble下载的信息又不全，咋整啊，老师?

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我鉴定的家族成员的基因ID和已经发表文献的基因ID不一样，如何让两者对应起来？下图左侧是文献中的基因ID，右侧是我鉴定出来的基因ID，数量一致。

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lefse分析细节

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老师，我正在做泛基因家族分析的系统发育树构建，构树过程中，出现以下的过程及警告，请老师帮忙看看是否正常，这些重新序列的编号是否有影响（序列对其修剪后有重复名称已去除），以及我下面的系统发育树这么多是否正常，还是需要筛掉一些？

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老师您好，我在提取cds的时候报错了。他说第84行出错，然后我打开看了，感觉看不出什么问题呢老师

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A基因家族的家族成员一共25个，但是23个成员是一个domain，只有是两个domain,这种情况，比较这个基因家族里面不同成员的蛋白全长是不是不合适？不容易得到25个成员的全蛋白进化树？

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请问老师，为什么显示找不到文件呢，已经尝试过重新传输文件

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老师我做存在缺失分析部分，Fam_gene.list中泛基因编号为什么不是连续的呢

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verkko组装后怎么生成.hic和.assembly文件

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关于填充gap后的polish

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新建物种特异hmm模型，再次搜索，产生的文件round2_hmmerOut.txt中的一个基因序列（下图所示），通过了三大数据库确认。但是序列很短，这个序列不要？

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全基因组关联分析GWAS教程中的beagle填充问题