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5 请问，首次使用MCscan (Python version)可视化作图时，没有mcscan_seqids和mcscan_layout文件，该怎么创建这两个配置文件呢？自己创建的配置文件运行后，结果文件有问题

  • 2021-11-13 18:34
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3 老师，我在运行MCSCANX查找共线性时，出现以下情况怎么解决啊？我的mcscanx软件已经成功安装在了biosoft中啊，

  • 2021-11-10 21:56
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5 老师，我利用linux运行mcscanx时一直提示以下错误，怎么解决啊？

  • 2021-11-09 15:21
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5 生信小白，求教基因组共线性分析报错问题（如图），请问是什么原因呢

  • 2021-11-09 14:12
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10 TCGA用R数据下载错误

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5 老师，您有没有mcscanx的压缩包文件啊，我网站打不开

  • 2021-11-04 23:40
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5 老师，我安装mcscanx软件时打开所给网址显示有错误怎么下载啊？

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10 转录组与转录组之间所有序列进行两两比对

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3 老师，想请教一下TCGA基因表达数据的问题，我从xena.ucsc网页上下载了基因表达数据TCGA-CESC.htseq_counts.tsv；然后发现该数据中只有Ensembl格式的基因ID ，没有SYMBOL格式的。所以接下来进行基因ID格式转换，却发现同一个SYMBOL ID对应的多个Ensembl格式的ID，想问下老师，这种情况该怎么处理？同一个SYMBOL ID所对应的多个Ensembl格式ID的基因表达数据应该留下哪一个？

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5 老师，我做基因上游顺势作用元件分析时出现这种情况是什么意思啊？

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3 老师，请教您一个生存分析的问题，为什么phenotype的删失数据天数一列中会出现alive time=0的情况,是病人还没开始实验观察就去世了吗？

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3 生存分析：老师,我看到了这个生存分析的代码在利用索引定义一个新的向量时先定义了一个,想请教一下您他为什么刚开始要定义一个纯0向量呢,先谢谢您啦

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5 筛选差异分析基因的时候上调下调基因数量差别太大正常吗？

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10 TCGA的RNA-seq count annotation过滤，有些不知道是否需要删除

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10 在01.phylo_tree ，文件格式转换这步，用您的docke或自安装 tassel-5 ，给vcf（23G)文件排序，排成tassel认可的序列，错误如下：Use -Xmx option in start_tassel.pl or start_tassel.batto increase heap size. Included with tassel standalone zip.

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3 生信小技能-引物设计课程脚本里SSR引物设计中为啥我把全基因组fa文件放进去会报错

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10 LD连锁不平衡计算关于碱基序列之间的关系

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20 我使用OrthoMCL处理blast产生的结orthomclBlastParser blastresult compliantFasta > similarSequences.txt，出现了问题，不知道怎么解决

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3 代码报错

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5 从ENA数据库下载fastq格式，可以点击这个进行下载吗？

  • TIES 2021-09-24 17:37