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5 请问利用jcvi整理泛基因列表，做JCVI做共线性分析时，一直提示/bin/bash: lastdb: command not found，是没有安装Last软件包吗？目前使用的镜像是购买课程时老师提供的，数据是26个玉米基因组数据（由于空间不足，只用了19个基因组）

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10 大家好，我想问一下，做进化树分析，想把一些文件从一个文件夹cp到新建的进化树的文件夹，但是cp的时候说找不到这些文件，但这些文件就在哪里，不知道这是什么原因呢，直接复制粘贴过去也不太行，在终端里ll一下依旧找不到。

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5 gatk变异检测

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5 请问泛基因家族分析实操课程中老师用到的泛基因列表为什么和课程泛基因集构建得到的列表不一样呢？

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3 gff3_file_to_proteins.pl 报错

  • Dg 2025-01-10 16:59
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5 MCMCtree没有输出Figtree.tre文件

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10 GATK报错Caused by: java.io.IOException: Input/Output error

  • YYJ 2024-12-30 20:45
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20 群体遗传构建进化树格式转换报错

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5 新手小白，刚开始学习docker，想问一下，做泛基因家族分析最开始，怎么将老师服务器中使用的加载环境变量用到的env.sh（还有老师课程中一些其他必须要用到脚本）粘贴到docker中呢

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3 为什么我的WGCNA分析运行到这一步就卡住了，但是显示分析中，WGCNA分析如何筛选数据啊，恳请各位大佬帮帮忙

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3 在进行转录组分析时，在自己的服务器上怎么使用以下命令，请老师帮忙解答；（没有root权限，docker镜像用不了，想在外部自己的服务器中使用）

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20 想要获取一下metagenomics:v1.0本地百度网盘镜像，谢谢

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5 mirdeep2预测miRNA时-k的接头序列，如何是双端测序怎么办？

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5 docker打不开镜像

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5 could not find function "newCountDataSet"运行deseq_analysis.r这个脚本报错

  • 荣 2024-12-12 16:45
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20 请教一下TCGA的蛋白数据怎么理解，它是有正负值的，这个正负值代表什么意思，为什么蛋白表达会有负值？我只想给它分成高表达，低表达和表达缺失组应该怎么处理呀？

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3 是否可以将同源聚类的结果命名成TPS1/2/3

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5 如何自己制作泛基因组的pangene.list呢

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3 关于泛基因组的pangene.list

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5 泛基因家族docker报错