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10 老师您好，做基因家族分析有几个问题不明白想问问您：（1）实在找不到组装到染色体的基因组，可以用scaffold水平的画基因重复性图吗？会不会影响发文章 （2）能不能分析两个比较有相关性的基因家族或者结合转录组分析，增加一点文章接受几率？（3）用hmmsearch筛选蛋白，构建新模型，再筛选，筛出来200多个蛋白，但是alignment之后发现保守结构域差别很大，gap特别多，是出了什么问题吗？

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5 请教老师mcscanX作图问题

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30 TCGA中比如说我要下病例报告，slide，还有msi怎么下载?

  • 2020-03-03 09:41
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3 请问在GEO中收到的比如肝癌的随便一篇文章的数据都能拿来分析自己的问题么？应该怎么选择用哪组数据

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5 老师您好，我想请问一下，通过分析找到的基因家族成员在NCBI上都是预测基因，继续分析没有问题吗

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50 如何解答以下问题呢？一直都是错的

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15 GATK中call SNP出来的SNP里面的ALT列出现 * 星号啥意思？

  • 2020-02-25 11:05
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15 GATK 建立压缩的VCF文件索引报错 IndexFeatureFile

  • 2020-02-24 16:52
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10 老师我想问一下用circos绘制基因组内共线性图时，config2.txt文件中的目标基因link.txt部分怎么更改才能使目标基因在图上的字体放大并且设置斜体？如下图：

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5 mcscan_layout参数都是有关什么呢？求教

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20 比较基因组学使用MCscanX报错，请老师抽空解答一下。

  • dec. 2020-02-23 18:19
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10 我按照系统说明进行biolinux的安装，但是在设置共享文件夹时总是报错，已经尝试过好多办法，还是没有解决。我现在特别着急弄这个，求各位高手指点！vbox实在官网下载的，biolinux.ova是从提供的网盘上下载的。

  • 2020-02-23 02:11
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100 你好！我参照《医学癌症TCGA-甲基化生存分析》中的方法做甲基化生存分析模型独立性验证时，将患者年龄分为3组分别进行验证，运行代码如图，但是运行后总是报错显示“找不到对象……”请问该如何解决？非常感谢！

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20 R安装包报错ERROR: failed to lock directory

  • 2020-02-21 16:01
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100 甲基化探针cg号转换为基因名

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10 在运用Linux系统命令，KA/KS，计算重复串联基因时，出现的duplication_gene文件，有点问题

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5 生信分析为什么要学习linux系统，好多不是直接通过windows系统的R语言就能解决吗？哪些分析时需要用linux，为什么不用windows，可以举例下吗？

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5 请问用什么软件可以批量的将CDS序列中最长的ORF序列提取出来？

  • 2020-02-10 01:02
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10 如何批量根据微生物种属名称下载某一功能蛋白的氨基酸或核酸序列？

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3 TCGAbiolinks使用求助 Downloading genome information (try:0) Using: Human genes (GRCh38.p13) Error: $ operator is invalid for atomic vectors