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WGCNA分析剪切高度怎么来确定？

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5 atacseq测的是RNA还是DNA，和chipseq有什么区别呢？

  • 2018-09-14 22:16
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有GO号，用amigo搜索GO注释，能具体点吗？

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5 老师您好：关于TCGA的生存分析，用训练集train来做单因素的生存分析筛选有意义的基因，为什么在鲁棒性分析的时候不用训练集，而是整个数据集exprSet呢？

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无参物种做三代全长转录组需要注意什么？

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如何检测鉴定植物内病毒？

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筛选不到串联重复基因

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请问，有些文献中，给出的KME值，在WGCNA教程中，生成的"10_GS_and_MM.xls"文件中，哪个和它是对应的？比如下图所示。文献链接如下：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5429000/

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5 老师，您好！我找不到MEME分析perl脚本，请求帮助！

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5 三代无参全长转录组做基因家族进化树分析时发现有多条序列的蛋白序列相同，有必要删除相同序列吗？

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5 请问一下，当用时期作为表型数据时，文件该是什么格式？行和列各怎么赋值，还有就是重复间要不要区分？

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相同材料不同处理之间，可相同材料不同处理之间，可以放在一起做WGCNA分析吗？比如重金属和盐碱处理。

  • 2018-09-13 11:36
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老师好，请问怎么找一个家族基因隐马尔科夫模型的pfam索取号

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有GO号，如何得到GO注释文件？

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WGCNA分析，前期数据载入Rstudio中出现“error reading from connection”，这该怎么解决？我看到官方网站就是这样的代码。

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WGCNA分析，计算了软阈值，为什么powerEstimate没有提供估计值？

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5 WGCNA分析中，取材是，有5个植物发育时间点，两个品质高低不同的材料，三次生物学重复，也就是三十个样本，请问，针对其中某个材料某个时间点中的一次生物学重复不好的剔除后，影响WGCNA的分析吗？还有就是时间点可以作为一种表型作为输入文件吗？

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转录组测序数据fastq统计结果怎么看？ 双端测序怎么计算reads数量？

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5 如何查询hmmer 版本？

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WGCNA分析，官网给出的代码中两次计算了dissTOM，两次代码不一样，结果会不会也不一样？