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老师您好,我按照课程提供的流程泡自己的数据,在构建进化树的时候利用run_pipeline.pl -Xmx200G -importGuess $workdir/00.filter/clean.vcf.gz -ExportPlugin -saveAs supergene.phy -format Phylip_Inter这个命令操作的,但生成的supergene里面有好多命名重复,这是怎么回事?由于这个重复就导致我没法做进化树
tassel
phylip
per
2024-06-04 16:19
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PSMC分析
PSMC
shidandan
2024-05-28 16:18
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如何计算LD衰减到一半时的衰减距离?
LD decay
shidandan
2024-05-21 23:55
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plink怎么设置样本的PPID,MID,Sex信息?
群体遗传
群体遗传学
群体遗传进化
plink
赵一琦
2024-04-20 09:47
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LDdecay衰减距离如何确定?
衰减距离
LD decay
CaiMJ
2024-04-19 20:04
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课程的IBD分析可以分析个体之间的IBD吗?计算得到的是IBD距离还是系数?想要通过IBD计算亲缘关系系数该如何操作?
IBD分析
IBD
群体遗传
赵一琦
2024-04-16 21:33
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PSMC出图报错
PSMC
Biluhelumina
2024-03-23 21:28
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进化树构建
tassel
yangxiang666
2024-03-20 07:55
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单倍型分析中最后一步失败,麻烦老师
单倍型分析
Chen jie yang xi rêve
2024-03-15 11:58
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水稻LD的衰减距离如何计算?
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kid
2024-03-12 17:18
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在singularity中复现遗传进化中数据过滤时出现以下信息导致clean.vcf.gz大小不符合demo
vcftools
WHR
2024-03-04 16:56
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群体分析下载的文件里面没有dadi分析的代码和脚本
卢楠
2024-03-04 13:57
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进化树画图
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yangxiang666
2024-02-23 16:36
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如何实现把InDel标记变为SNP格式?
执着的梦~
2024-02-20 11:15
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shidandan
2024-02-19 15:59
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关于TajimaD的筛选问题
章鱼哥吹笛子
2024-02-02 09:55
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关于TajimaD计算问题
Tajima
shidandan
2024-01-29 21:59
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请问老师如何看选择清除分析中的选择信号值?怎么判断受选择基因的选择强弱?从基因列表中只能获得基因的位置等信息。
Fst
PI
shidandan
2024-01-28 17:05
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群体遗传PCA分析报错
PCA分析报错
陈黑手
2024-01-14 23:12
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回答
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群体遗传进化中合并候选基因区间失败,文件是bed格式,麻烦老师解答
bedtools merge
Chen jie yang xi rêve
2024-01-08 11:57
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