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Error correction and assembling warnings: * 0:12:28.935 6768M / 13G WARN General (kmer_coverage_model.cpp : 327) Valley value was estimated improperly, reset to 16

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fastsimcoal

  • lint 2025-03-21 10:37
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老师，为什么我把data数据链接过来的时候链接不过来，会出现这样页面？

  • 2025-03-07 09:30
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怎么从泛基因组call SNP呢？

  • 2025-03-05 17:34
2 解决

10 参考咱们的T2T组装课程 进行基因组组装后，染色体出现了一个超级染色体，各染色体大小分布非常不均匀

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老师，请问分析fasta格式的文件需要全部转成gff格式再分析吗？

  • 2025-02-26 23:00
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基因结构注释效果不理想

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老师，我有20个不同菌株的基因序列（fasta文件），请问怎么进行基因组学分析？

  • 2025-02-23 13:46
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二代DNA测序数据进行kmer分析，结果如下图，想请问可能的原因和建议。

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比较基因组构建进化树，通过seqkit进行序列合并时内存爆满导致kill

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老师，我更换镜像了，但本地镜像一直加载不了，显示如下。然后，我在服务器上，导入镜像，运行docker run -it --rm --name pangene --group-add keep-groups -v /home/us132/pangene:/work localhost/omicsclass/pan-gene-family:v2.0做了泛基因集构建。之后继续做其他分析，然而，运行镜像时一直出错，进不去，错误显示如下。

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在运行table_annovar.pl脚本的时候报错

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老师，我提取cds ，pep用基因的ID，作为序列的ID命令。运行出来"No such file or directory; can't open file ./.longest_isoform.gff3"但是我打开输出文件看是有数据的。是不是不用管No such file or direc...提示

  • aa1 2025-01-09 16:36
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老师，我想知道我在用你们演示的玉米数据提取cds和pep的脚本为什么都运行不对，第一个我是用了你们给的TransDecoder下载地址。第二张图用5.7版本的自己的数据是输出空文件

  • aa1 2025-01-08 19:57
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老师，gff文件保留最长转录本有蓝色那一行的可以输出成功，上面没有那行输出的就是空白文件，我想知道没有蓝色那行的gff文件是不是可以自己照着格式写一行

  • aa1 2025-01-07 23:47
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二代和三代sv数据合并出现问题，若能回答，万分感谢

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群体sv分析

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线粒体基因组组装挑选contigs的标准是什么？

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5 MCMCtree没有输出Figtree.tre文件

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运行go_enrich.r报错