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二代DNA测序数据进行kmer分析，结果如下图，想请问可能的原因和建议。

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比较基因组构建进化树，通过seqkit进行序列合并时内存爆满导致kill

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老师，我更换镜像了，但本地镜像一直加载不了，显示如下。然后，我在服务器上，导入镜像，运行docker run -it --rm --name pangene --group-add keep-groups -v /home/us132/pangene:/work localhost/omicsclass/pan-gene-family:v2.0做了泛基因集构建。之后继续做其他分析，然而，运行镜像时一直出错，进不去，错误显示如下。

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在运行table_annovar.pl脚本的时候报错

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老师，我提取cds ，pep用基因的ID，作为序列的ID命令。运行出来"No such file or directory; can't open file ./.longest_isoform.gff3"但是我打开输出文件看是有数据的。是不是不用管No such file or direc...提示

  • aa1 2025-01-09 16:36
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老师，我想知道我在用你们演示的玉米数据提取cds和pep的脚本为什么都运行不对，第一个我是用了你们给的TransDecoder下载地址。第二张图用5.7版本的自己的数据是输出空文件

  • aa1 2025-01-08 19:57
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老师，gff文件保留最长转录本有蓝色那一行的可以输出成功，上面没有那行输出的就是空白文件，我想知道没有蓝色那行的gff文件是不是可以自己照着格式写一行

  • aa1 2025-01-07 23:47
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二代和三代sv数据合并出现问题，若能回答，万分感谢

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群体sv分析

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线粒体基因组组装挑选contigs的标准是什么？

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5 MCMCtree没有输出Figtree.tre文件

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运行go_enrich.r报错

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在运行core_pan_gene_curve.r的时候报错

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基因组偏大

  • Song 2024-12-19 22:18
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基因组注释问题

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用ALLHIC挂载出现报错

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泛基因组 eggNOG得不到结果-2

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泛基因组 eggNOG得不到结果

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基因组组装着丝粒问题

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基因组组装后进行merqury评估出现问题