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genome-annotation缺失tantan

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同一物种批量注释基因组

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mcmctree能否多线程运行？

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叶绿体组装使用软件Gepard报错问题

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老师好，我在运行比较基因组学11.time_tree_BV脚本的时候，报错Error: Only bounds for the root age are implemented，修改了几次化石时间节点也没有成功，请问这个是我的化石节点选的有问题么？

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quickmerge合并多个软件组装的基因组后，使用nextpolish去polish基因组，得到的结果的N50比打磨前的低是正常的吗？基因组由549M打磨到了531M，总的contig条数没变，N50都是N=3.

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基因组注释提取，gff3_file_to_proteins.pl 序列出错，跟官网给的序列不一致

  • 2023-09-08 21:24
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PASA update 报错

  • 2023-09-01 17:15
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用singularity做Braker时，出现与前文相同的报错，求解

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PASA Can't drop database

  • 2023-08-28 15:44
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蛋白比对结果构建进化树_合并成supergene报错

1 解决

基因结构信息统计脚本报错

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cafe做基因家族扩张和收缩，报错Failed to initialize any reasonable values

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想问一下，边界分析做出的图，和它描述的序列特征表中的各个区的长度不一致的话，是正常的吗？会不会有什么影响呢 叶绿体分析

  • 2023-08-11 10:51
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叶绿体基因组GetOrganelle组装时出现killed，内存从10G改为30G又改成70G，但是还是不行，程序终止。

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在做叶绿体组装时，出现了如下错误，该如何解决呢

  • 2023-08-07 21:25
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做物种间共线性分析时报错，这是因为什么

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比较基因组，无法获得pep和cds序列

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allhic流程时，过滤步骤输出文件大小为0

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30 cafe进行基因家族扩张和收缩分析，重复报错Families with largest size differentials