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老师，我在做共线行分析时，出现这种情况，该如何解决

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请问scaffold序号和染色体序号有什么关系？分析得到基因定位在scaffold上怎么解释？谢谢老师

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请问如何知道用MEME预测的motif代表的具体结构是什么（譬如说C2结构盒以及这个结构的功能）

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老师您好，请问使用Docker时需要把测定数据定位到基因组上吗？

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请问要提取每一条fasta序列>这个符号之后的第一行内容 该怎么在虚拟机下设代码呢

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怎么确定突变速率r呢？

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基因家族分析

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能否通过某种软件预测真基因和假基因

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请问在进化树+基因结构+motif+domain的四联图中，为什么domain结构在tbtools上显示不出来？？以下是我设置的domain文件，请看看有何不妥？谢谢

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请问如果在染色体定位中发现一对串联重复基因位于不同的两条染色体上，这说明什么？？可以说明他们的复制方式是串联重复还是片段重复吗？？

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5 请问基因家族中串联重复基因的KAKS 数值在哪看？？有表示出来吗？？这一步的意义是什么

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10 请问有无预测蛋白质与蛋白质互作或蛋白质与DNA互作的网站？

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5 如何从CAFE结果中提取扩张（或收缩）的基因家族

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为什么用plantcare预测顺式作用元件时，很多基因连基本启动子元件都没有？？？不可能啊

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基因组分析能具体展示ka/ks的数值吗？？

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3 共线性分析做组间时，anchors文件只有以下内容，进行后续筛选和绘图时，报错为“need more values to unpack"，请问是何种状况？mcscanx分析有物种和同源性要求吗？

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请问组内共线性的circose图是这样说明了什么？

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如何使用正则表达式删去gene字符之前的内容？？并且在每行首加一个>??

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5 基因id与cds id不一致，无法提取cds序列怎么办

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5 MCScan(jcvi) 生成anchors文件大小为怎么办？？？