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老师;我这儿GFF3文件格式和教学视频不一样;蛋白序列上显示gene_id有三个;我不知道如何选取哪一个进行接下来的GFF3基因位置分析;GFF3文件上没有染色体位置信息,和教学视频的格式不同-gene出现在第3列;gene_id出现在第9列我该如何选取有效的ID呢?如何修改Perl脚本?如何能成功提取基因位置信息呢?望老师指点!谢谢呢
酒七
2019-03-08 08:50
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MCSCANX共线性图代码报错
MCScanX
YJY
2019-03-06 12:05
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如何进行分子调控网络解析?找出下游靶节点,筛选出互作蛋白。
刘世平
2019-03-06 11:28
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请问我要分析的物种里gff文件没有染色体命名信息,该怎么办
基因家族
Jenny
2019-03-06 10:29
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怎样获取全基因组的蛋白序列
Angelo
2019-03-05 22:35
1
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做基因组测序是二代、三代、Hic、光学图谱的作用分别是什么?
基因组
组装
2019-03-01 08:21
1
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关于MSCanX画图问题
我在这里不要怕.
2019-02-28 20:16
1
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5
DNA甲基化测序为什么比重测序贵那么多?
DNA甲基化
价格
2019-02-23 13:04
1
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请问DNA甲基化测序和MeDIP-Seq是什么关系?
甲基化
MeDIP-Seq
2019-02-23 12:54
1
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5
各位老师,请教个问题,二代测序获得的病毒数据库中存在部分细菌序列污染,请问这个细菌污染序列怎么去除比较好?
测序
周亮
2019-02-17 20:48
2
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关于python版本的MCScanX绘图问题
我在这里不要怕.
2019-02-05 17:25
1
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Mscanx染色体名称显示问题
我在这里不要怕.
2019-01-25 16:30
1
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python版本的MCScanX绘图(比较基因组学)
我在这里不要怕.
2019-01-24 21:53
2
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关于新版BIO-LINUX共线性问题
我在这里不要怕.
2019-01-22 16:58
1
回答
3912
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使用blastq进行比对的时候出现的这种问题
基因家族
刘克思
2019-01-16 19:36
0
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3193
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请问在比较基因组学中,怎么区分由祖先染色体加倍还是物种分化后独自加倍而形成的同源基因?比如下面的玉米A和B基因组
比较基因组学
不一样
2019-01-14 13:56
1
回答
3413
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我的基因组文件很奇怪,转录本不是正常的加个“.1”“.2” 我就全部都去掉了只剩下基因ID,在提取蛋白序列的时候怎么将将本 get_fa_by_id修改一下才能提出来呢
转录本
Milan Shepherd
2019-01-14 13:53
1
解决
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视频课程已经学完,有一个问题,视频中演示的搜索拟南芥的NB-ARC基因家族,这里的拟南芥指的是拟南芥属吗,是有很多不同种的拟南芥组成的吗?
ensembl
七比比
2019-01-07 16:49
1
回答
8115
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3
如何获取一个基因家族在拟南芥植物中的所有成员!!!
基因家族
刘克思
2019-01-06 10:59
1
解决
3762
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计算KaKs时,axt文件中两序列长度一致,但是仍然提示“not equal”(详情见下图)
KaKs
Timwang
2019-01-02 09:23
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