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宏基因组分析,用来分组的metadata格式具体是什么?
metadata格式
越今朝
2025-01-07 19:11
1
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binning 想做功能注释,但还是不知道该用哪些文件进行基因预测和功能注释?
宏基因组
George
2025-01-02 14:56
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binning物种注释的时候,gtdbtk软件和数据包已经更新,旧版的匹配不上,请问应该怎么更新一下软件,谢谢
宏基因组
George
2025-01-02 11:44
1
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170
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想咨询一下,可否有contig的NR库的物种和功能注释代码和教程?
George
2025-01-02 02:39
0
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想咨询一下,可否有contig的NR库的物种和功能注释代码和教程?
宏基因组
George
2025-01-02 02:39
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想咨询一下,宏基因组功能注释的视频中,有一步是用cds.fa文件注释物种,想咨询一下,这个物种注释出来后,应该如何计算丰度?是根据前面cds.count来计算吗,这样计算出的物种丰度可靠吗?因为有些物种可能基因很多。
宏基因组
George
2025-01-02 02:36
1
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请问,我弄了一个256线程,1t内存的服务器,想处理500G的宏基因组注释,大概需要跑多少天,全套下来
宏基因组
George
2025-01-01 07:11
1
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309
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binning功能注释
George
2024-12-24 22:32
2
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304
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请问功能注释里面,想注释KEGG
George
2024-12-24 11:15
1
回答
243
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不知道为什么,产生不了unmap文件
宏基因组
George
2024-12-23 09:44
1
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285
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想请教一下,我是基于windows+docker做的宏基因组注释,然后在去宿主这一步,卡住了 不知道为啥 一直不动
宏基因组
George
2024-12-20 19:09
1
回答
262
浏览
宏基因组单独组装后的contigs需要注明来源以构建基因丰度表,混合组装呢
基因丰度表
murakami
2024-12-17 17:32
1
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267
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宏基因组预测后使用salmon计算物种丰度的TPM值可以直接相加吗?
TPM
murakami
2024-12-17 16:39
2
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357
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已经windows系统里下载了docker 也打开了,但还是运行不了. doc.sh
George
2024-12-17 15:13
2
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224
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为啥这个. doc.sh后,显示不是内部或外部命令,也不是可运行的程序
George
2024-12-17 11:10
1
回答
238
浏览
20
想要获取一下metagenomics:v1.0本地百度网盘镜像,谢谢
宏基因组
George
2024-12-14 12:48
0
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195
浏览
您好,想和您咨询一下,我用土壤样本测微生物宏基因组注释,40个样本,一共500g左右,想和您咨询一下,一定要用服务器吗,普通电脑96g运行内存有可能注释出来吗,感谢感谢
George
2024-12-13 18:54
0
回答
209
浏览
您好,想和您咨询一下,我用土壤样本测微生物宏基因组注释,40个样本,一共500g左右,想和您咨询一下,一定要用服务器吗,普通电脑96g运行内存有可能注释出来吗,感谢感谢
注释文件
George
2024-12-13 18:54
1
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424
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物种注释出现killed,我调了参数还是出现这个问题,除了用台式机或者服务器之外还有别的办法吗?
qiime2
云海
2024-10-31 23:52
1
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576
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deblur生成featrue-table出现错误
16S
qiime2
deblur
云海
2024-10-27 11:26
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