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老师 ,您好,我想请问一下qiime2双端拆分barcode的事情,如果您回复,将感激不尽
qiime2
Barcode
Ading耶
2021-01-17 12:34
1
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老师您好,我根据课程步骤的指令,改不了文件的格式,我能找到format_fa_for_qiime.pl文件,还把它放到了操作的文件夹,但是电脑找不到这个文件,是什么原因呢
16S
小野猫
2020-12-24 11:32
2
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多样性数据实操 OTU注释报错
qiime
16S
清风徐来
2020-12-20 10:32
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您好,我使用rescript结合您发表的qiime2分类器建立sliva数据库一文,发现自己做到最后一步,数据库训练时一直显示内存不够,除了增加内存,还有没有其他的办法解决这个问题?例如,设置那些参数之类的?或者,我还要多大的内存才能做呢?谢谢
qiime2
秦明森
2020-12-17 22:08
1
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cytoscape插件conet运行报错
Cytoscape
conet
鑫双
2020-11-22 18:58
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微生物多样性分析的程序复制shell中不能运行
gump23
2020-11-03 14:24
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16S多样性分析docker镜像发布及使用中,合并fasta文件,并加序列号部分的命令中,rename_fa_id.pl显示没有此命令,请问老师是怎么回事?
rename
16S多样性
肥尔普嵩
2020-10-17 22:40
1
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小白来提问:哪位大佬能给我说一下OTU分类吗?看定义不是很懂,才接触这方面知识。
OTU
2020-10-15 16:39
1
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视频里面说的 amplicon.demo.tar.gz 和 data base . ta ,这两个压缩包,不知道怎么下载,可以提供一下吗?第一次用这个提问,可能重复提问了,抱歉。
16S
嘉
2020-09-15 16:38
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UPARSE to pick OTUs in QIIME
qiime
2020-08-26 13:35
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老师您好,我在做宏基因组学分析时,由于样本数据量过大,将所有样本质控后的reads用进行组装时,会出现服务器内存不足无法组装的情况。那我想将每个样本的数据分别组装,然后将样本contig文件进行合并后再进行下游分析。这种方法可行吗?
姜淞
2020-05-30 21:39
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想请教一下,conet网络构建的课程,用提供的数据文件分析完全可以,但是用我的数据文件就报错。我尝试了用测序公司提供的xlsx格式,并把数据形式改成和课程提供数据完全一样,再转化成txt制表符文件格式后输入,选择第二个选项(由biom格式转化来的文件),结果报错。把测序公司提供的biom格式文件输入,选择第三个选项(biom HDF5格式,还是报错)。这是什么问题呢?
conet
twinkle star
2020-05-20 20:34
1
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老师您好,请问在利用conet作分析的过程中置换检验大概需要等待多久完成,电脑一直处于计算状态。。。
2020-05-14 19:42
1
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CoNet构建OTUs网络图,一直报错!
conet
张志浩Zhang Zhihao
2020-03-20 16:34
1
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老师,请问我在cytoscape中使用conet插件绘制互作网络图,我上传了两个文件,第一个文件是图一,第二个文件是图二,我不想用OTU的ID号做分析相,想做门水平的细菌,第二个表是抗性基因的数据,想观察抗性基因和门水平菌的共现性网络。但是总是显示报错,请问您知道大概有什么原因吗?
conet
王足各
2020-03-12 19:46
1
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疾病与正常对照的微生物群落CoNet分析
16S
Lynn
2020-03-07 21:00
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疾病与正常对照的微生物群落CoNet分析
conet
Lynn
2020-03-07 20:37
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Cytoscape的CoNet插件相关性阈值的设定
conet
Cytoscape
wang_jy
2020-02-10 11:52
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如何批量根据微生物种属名称下载某一功能蛋白的氨基酸或核酸序列?
mandlaa
2020-02-09 10:40
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结构方程模型中细菌或真菌群落组成表示
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Manjing
2020-01-11 21:27
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