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perl语言命令行参数设置

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10 由于gff3文件第九列的格式问题，无法运行课程的脚本

  • Mask 2023-12-26 22:08
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3 每次拿基因id去gff3文件里做比对找信息(perl)，输出空白

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各位老师好，我在使用geneid_to_mRNAid脚本提取自己基因组gff文件时报错了,但提取其他的是正常的,请问是怎么回事?

  • 2023-07-28 01:44
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你好老师，我是首次接触家族基因分析，数据从ncbi下载，想要转换一下格式，使用你的脚本，出现这个情况，该怎么办呀？

  • jay 2023-05-07 16:35
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使用get_promoter.pl提取序列时出现报错，好像第15行出现问题

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SSR引物设计

  • long 2022-10-21 21:51
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我想问下 生信引物设计的课 里面用docker上面的ssr引物设计程序设计出来的引物 是经过E-pcr筛选的吗 我看课里老师介绍了pl文件介绍里面有E-pcr程序 但具体有没有运行呢

  • 2022-01-24 10:00
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$motif{++$nr} = $motif; 麻烦直接解释一下{++$nr} ，代表的意思谢谢

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这是提取SSR,标记的脚本，{ my $redmotif = "([ACGT]{$j})\\1{".($motiflen/$j-1)."}；"my $search = "(([acgt]{$motiflen})\\2{$minreps,})"；这句代码代表啥意思，特别是\\1{".($motiflen/$j-1)."\\2{$minreps,}这两句代表啥意思

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看了perl 语言高级编程课后，对这句脚本不理解my $redmotif = "([ACGT]{$j})\\1{".($motiflen/$j-1)."}";请帮忙解释一下，谢谢，特别是这句\\1{".($motiflen/$j-1)."}

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老师们好，我使用misa工具搜索ssr，网上教程是接下来用primer3设计引物，但是我的电脑是mac系统，网上教程大多是win的，所以就卡在了这一步。请问mac系统可以装primer3吗？misa生成的结果文件还有什么方法可以批量设计引物呢？

  • 2021-08-01 01:29
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基因家族分析课程脚本不全

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老师，我在利用perl ../script/get _ene _ exon_ from _ gff.pl in1 时，老是提不出文件，他说十几行不合适但是这个和视频里面的一样，

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MISA

  • LIU 2021-03-19 18:00
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老师在利用perl提取大豆转路本的一天cds时候脚本应该怎么修改，我用的是组学大讲堂基因家族分析的视频，大豆转录本没有.1 或者.2现在导致提取不了cds序列

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请问在提取对大豆进行共线性分析，在提取一条大豆转录本的cds时候脚本怎么修改，大豆转录本没有.1或者.2用的是组学大讲堂基因家族分析课程的的提供的脚本

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您好，可以分享一下script/get_mRNA_position.pl这个脚本吗?

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麻烦老师请问为啥会出现这种报错？

  • 2021-02-04 16:00
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如何安装bioperl?