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利用GATK 分染色体call 变异时出现错误

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GATK 很慢，怎样分染色体CALL 变异

1 解决

GATK硬标记过滤速度慢

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老师，我在做dadi分析的时候，发现没有代码里显示的easySFS.py的脚本，给的文件里也没有，就一直报错

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老师，合并后的VCF文件，现在有几品种不想要了，如何从总的VCF文件中删除这几个品种的数据

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合并GVCF文件

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测序文件中提取基因序列

  • bomm 2025-03-09 22:57
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老师您好，分析SNP和INDEL时报错，请解答。

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重测序分析

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老师您好，我在参考基因组比对的时候，出现报错，请老师解答

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老师您好，我在参考基因组比对的时候出现报错

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老师您好，在参考基因组比对时出错。

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老师您好，我的重测序数据在NCBI上按照（双端下载是这样：https://www.omicsclass.com/article/1703）这个教程下载的，但是在做数据质控的时候总是报错，以下是数据，您看看哪儿存在问题。

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重测序分析

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如何下载别人的重测序数据

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xpclr报错AttributeError: 'NoneType' object has no attribute 'keys'

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命令无法运行

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5 gatk变异检测

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XP-EHH

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根据覆盖度及比对率如何剔除样品、gatk VariantFiltration过滤