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GATK生成的vcf文件基因型有不是二倍体的(基因型只有一个值),该怎样理解和处理这些SNP?
vcf文件
七夕后21天
2022-03-22 15:32
1
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老师你好 我在用gatk合并gvcf文件的时候 系统提示有一个样本的gvcf文件某一行数据出现问题 这种情况应该怎么解决 是需要重新生成这个样本的gvcf文件吗?
GATK
St.Sky
2022-02-26 16:33
1
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2966
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gatk4 HaplotypeCaller报错
xinhj
2022-02-20 22:18
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老师,你讲的ssr引物设计,我按步奏为什么结果文件是空的
超光速fly
2022-02-18 15:46
1
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为什么ssr引物设计结果为空
超光速fly
2022-02-18 10:07
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HGMD数据库
HanKui
2022-01-22 00:10
1
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1914
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老师好,请问课程bsa分析中,mutmap能同时输入两个子代混池吗?
BSA
mutmap
菜兮
2021-12-28 13:17
1
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2001
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两个群体的snp-index怎么算?
snp-index
BSA;QTL-seq
2021-12-27 16:25
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1615
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诱变材料,且已自交 6 代,是否可用 QTL-seq 的方法来定位到基因?
《心向阳光&
2021-12-27 12:05
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gama 射线引起的大片段缺失
gama射线诱变
《心向阳光&
2021-12-22 13:19
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2705
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mutmap方法为什么必须要有回交过程?
mutmap
2021-12-22 10:53
0
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做关联分析时能否将颜色的RGB数值组转化成0到1或者-1到1的单个数值?求教!可付费!
短歌行向阳花
2021-12-21 08:42
0
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1429
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同一目下边的俩物种,基因组测序数据mapping率只有20%,这合理吗?
安静,安好
2021-12-10 15:08
1
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在01.phylo_tree ,文件格式转换这步,用您的docke或自安装 tassel-5 ,给vcf(23G)文件排序,排成tassel认可的序列,错误如下:Use -Xmx option in start_tassel.pl or start_tassel.batto increase heap size. Included with tassel standalone zip.
旱钮
2021-10-14 15:51
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如何添加内参物种构建进化树
构建进化树
Iron
2021-10-13 20:45
1
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生信小技能-引物设计课程资料里没有脚本
燊燊
2021-10-10 19:43
1
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在您的课程《基因组重测序数据分析实操课程》中:变异结果注释ANNOVAR,在运行table_annovar.pl 如何解决报错:Died at /data/home/sft/pkg/annovar/coding_change.pl line 677
ANNOVAR
智
2021-09-26 21:11
1
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老师您好,我利用Fst、π和Tajima's D方法对2个种群的重测序数据进行了选择清楚分析,获得了候选基因,我想请问一下筛选到的基因就是受到正选择的吗?需要怎样判断哪些基因受到正选择,哪些基因受到负选择?谢谢老师!
选择清楚分析
LLING
2021-09-25 15:35
1
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1927
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参考基因组是scaffolds水平,如何进行比对
摅广
2021-09-20 19:31
1
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3295
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GATK HaplotypeCaller - Shutting down engine
GATK
omicsgene
2021-09-17 09:37
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