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5 WGCNA分析基因筛选

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老师，在做共线性分析的时候，在gff文件中提取出来的基因位置信息和ID号，与蛋白质文件中的ID号不一致，一个为基因号，一个貌似为转录本的号，所以提不出来蛋白序列，这种情况应该怎么办呢？并且有些基因在哪条染色体上也没有研究清楚好像，所以提出来的有些基因的染色体号为0，那如果这样的话还可以往下做共线性分析吗

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老师，我想问一下共线性分析时family.txt中的染色体实例上是at1,2,3,4,5，那这个数据是根据基因家族的ID代表的每条基因所在的位置得来的吗，如果我研究的物种基因家族分布在12条染色体上，那我就要写成1,2,3,4,5.....12，是这样的吗

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老师您好，我发现基因家族课程里共线性分析只有基因组内的分析，没有基因组间的分析操作实例演示，二者操作起来有什么注意的吗

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老师，我想请教一下做共线性分析遇到这种情况是什么原因呢

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5 利用hmmer软件鉴定基因家族成员，用的1e-20搜索，没有找到相应的domain

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5 老师好，通过拟南芥蛋白序列获得的隐马尔科夫模型文件可以用在别的物种上吗？

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请问一下在circos官网怎么找到这种图片的配置文件

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5 meme中motif site和scanned site

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5 MCSCANX共线性图代码报错

  • a猫 2018-12-12 09:11
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R语言获取GSE数据集warning

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30 我共线比对结果就这么点是为什么

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5 共线性 做blast时e值是否固定的

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5 作共线性分析的时候，用水稻的bed文件，无法获得水稻的cds，是不是因为水稻的cds.fa文件内是os08t0254300-00，而不像拟南芥的at012358.1这样后缀不一样，所有无法过去它的cds

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5 有关多个基因的聚类分析

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5 TBBOOLS三图合一时出现问题

  • 2018-12-09 21:05
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基因家族分析课程get_fa_by_id.pl脚本问题

  • 2018-12-09 20:34
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