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问题 重复序列注释的问题

求助老师,在用docker镜像进行重复序列注释中,出现如下错误,请问老师该怎么解决: Reading liftover chains Couldn't open /work/data/genome.chain , No such file or directory 另:在一次全部运行 01.Repeat.sh时,如果中间出现报错,是要重新运...

问题 老师您好,下载镜像失败显示这个该怎么解决?

Error response from daemon: Get "https://registry-1.docker.io/v2/": net/http: request canceled while waiting for connection (Client.Timeout exceeded while awaiting headers)

问题 fasttree 建树时没有找到这个软件

在用你们的docker建树时fasttree软件没有运行,报错如下: [us002@omicsclass-a02  16:47:41 ~/pop/pop_cucu_demo/01.phylo_tree]$fasttree -nt -gtr  supergene.phy   >  fasttree.nwk-bash: fasttree: command not found

问题 MYSQL做pasa_update的时候报错

老师您好,我用的docker,做基因组注释到pasa_update 的时候报错了,请问怎么解决呢?麻烦老师了

问题 想做GWAS练习,但进入不了助学大讲堂的镜像

打开Putty,使用组学账号(us082)登陆后想做GWAS,但是到docker run命令那执行不了,进不去了

问题 在进行物种累积丰度曲线时提醒没有该命令

 species_accumulation_curve.r  -i $workdir/4.export_data/feature_table_tax_rare.txt  \         -n species_accumulation_curve 是docker·镜像里没有装r吗

问题 关于终端使用过程中显示光标移动的问题

如图,上次docker desktop使用失败后,我卸载重下了一遍,但这次在我使用终端的过程,却总是出现光标向上一个命令行移动的情况,而且我也没有办法移动它 ,就像是卡住了,但是这个光标却能够继续打字?请问这会是什么原因...

问题 gene-family:v2.0中的blast软件版本

老师好,使用docker镜像gene-family:v2.0进行blastp比对,请问写文章时blast软件应标注哪个版本呢?谢谢

问题 注释完绘图出现报错信息

求老师解答:实验室组内服务器,没有用docker镜像。出现 Error in library("getopt") : there is no package called ‘getopt’ Execution halted 检查R里已经安装了getopt,调用这个R包也是正常的,但是perl $scriptdir/vcf_stat.pl -vcf snp.unknown_multianno.vcf -t...

问题 请问怎么从镜像里拷贝pl脚本

agat_sp_filter_feature_by_attribute_value.pl agat_sp_keep_longest_isoform.pl 课题组服务器不让安docker,请问怎么怎么从omicsclass_gene-family镜像里下载这个几个脚本呢我下载镜像文件到本地,解压后是一堆随机码命名的文件

问题 docker运行qiime1时按照教程进行到章节2课时6时,即聚类生成OTU-denovo时老是报错,查看类似问题后,升级了运行内存为70g,同时将教程内的30多个样本减成2个样本,FASTQ格式还有qimme格式检查都正确,依旧报错,报错内容如下:

docker运行qiime1时按照教程进行到章节2课时6时,即聚类生成OTU-denovo时老是报错,查看类似问题后,升级了运行内存为70g,同时将教程内的30多个样本减成2个样本,FASTQ格式还有qimme格式检查都正确,依旧报错,报错内容如下: pic...

问题 下载不了镜像(omicsclass/pop-evol-gwas:latest)

老师您好,我在进行群体遗传进化分析时下载不了docker中关于omicsclass/pop-evol-gwas:latest镜像,一直显示报错,请老师帮忙解决

问题 老师您好,新安装的服务器显示镜像下载失败

error pulling image configuration: download failed after attempts=6: tls: failed to verify certificate: x509: certificate is valid for *.bjfu.edu.cn, bjfu.edu.cn, not production.cloudflare.docker.com

问题 《微生物多样性数据分析实操》课程资料的下载

已经购买了《微生物多样性数据分析实操》课程。该课程相关的数据、脚本等资料有链接可以下载吗?我没有使用docker软件,所以咨询有没有下载地址,谢谢!

问题 GSDS网站本地部署使用一次后,再提交就显示空白页

我已经通过贵公司提供的方法用Docker部署了本地的GSDS网站,能正常打开,但是使用一次后,再Submit就显示空白页,之后就没反应了。这样该怎么处理