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问题 braker.pl运行中断

...示error,但是没提醒具体的问题。请问如何解决?是用的docker运行genomic-annotation这个镜像

问题 docker运行qiime1时按照教程进行到章节2课时6时,即聚类生成OTU-denovo时老是报错,查看类似问题后,升级了运行内存为70g,同时将教程内的30多个样本减成2个样本,FASTQ格式还有qimme格式检查都正确,依旧报错,报错内容如下:Segmentation fault

docker运行qiime1时按照教程进行到章节2课时6时,即聚类生成OTU-denovo时老是报错,查看类似问题后,升级了运行内存为70g,同时将教程内的30多个样本减成2个样本,FASTQ格式还有qimme格式检查都正确,依旧报错,报错内容如下: pic...

问题 xpclr 软件不能运行

...s002@omicsclass-a02  12:28:21 ~/work/pop_cucu_demo/05.select_sweep/xpclr]$docker imagesREPOSITORY                          TAG         IMAGE ID      CREATED        SIZElocalhost/omicsclass/pop-evol-gwas  v2.0        efcdf45e89d0  7 months ago ...

问题 在用cmscan进行ncrna注释的时候出现了segmentation fault (core dumped)

在服务器中用docker里面的cmscan进行ncrna注释的时候出现了segmentation fault (core dumped)

问题 使用qiime2导入数据时,一直报错,不知怎么解决。万分感激!!

老师们你好,我在使用docker做qiime2分析自己的数据时,讲数据导入qiime2这一步时,报错了,manifest文件按照视频里做的,找了很多原因一直都是同样的报错代码,不知道怎么办。麻烦老师可以指教下吗??

问题 请问怎么从镜像里拷贝pl脚本2.0

...—(以下是问题背景)——————课题组服务器不让安docker,请问怎么怎么从omicsclass_gene-family镜像里下载脚本呢我下载镜像文件到本地,解压后是一堆随机码命名的文件

问题 你好,我不小心把镜像下载到C盘了,不小心爆盘了。有办法解决吗? windows

修改docker镜像的默认存储位置

问题 服务器超过5个线程,被killed。请问怎么使用名单规定线程?下面命令如何修改规定线程。

docker run --rm -v /home/us180/gene-family:/work -it omicsclass/gene-family:v2.0

问题 在singuarity使用gatk时调用不了HaplotypeCalle指令

... /public/software/singularity/bin/singularity exec /public/home/huangyou/docker-images/reseq-v2.0.sif gatk --java-options HaplotypeCaller -R /public/home/wangyongsheng/PepsiCo_OT3098_V2_panoat_nomenclature.fasta \ -I /public/home/wangyongsheng/oats/text/picard-bam/${i}.sorted.dedup.bam \ -O /pub...

问题 请问request returned Internal Server Error for API route and version http://%2F%2F.%2Fpipe%2Fdocker_engine/v1.24/containers... check if the server supports the requested API version 这个问题该怎么解决

运行docker 解析gff信息时,中断, docker软件的containers中出现 request returned Internal Server Error for API route and version http://%2F%2F.%2Fpipe%2Fdocker_engine/v1.24/containers/025fef2a3e783d8c473c644d58e2ffd31be5f157743e797b0649966a18031dfc/json, check if the server supports ...

问题 基于Python的mcscan的微共线性分析问题

...来,就是到了arrow和着色就不行了,想问一下,在咱们的docker里面是不是路径有问题,或者python的版本低了呢?请帮忙解答一下,谢谢了。 第一次出现问题:频率最高 第二次出现问题:

问题 新手求助,基因家族分析的第6课时,老师演示在dockerdesktop里面进行复制和解压,求一下在这之前的命令

你好,我想问一下,基因家族分析的第6课时,老师演示在dockerdesktop里面进行复制和解压,在这之前打开powershell,在里面输入的运行docker的命令是什么,

问题 基因家族分析共线性的时候没有大片段复制的基因对 正常吗

老师您好:         我是根据docker课程学习基因家族,做自己的物种,共鉴定到22个HSP70基因,,到MCScanX的时候,使用excel的vlookup函数,找到一对串联重复的基因,但是没有大片段复制的基因,作图时也没有红色的线条,,,...

问题 扩增子分析 :qiime2分析-多样性分析alpha-beta-差异比较等 课程中的问题

#添加分类信息时报错 这是用qiime2分析完数据后,再利用qiime分析时候报错 #自己用服务器进入的ampliseq-q1:v1.2使用的命令:docker run --rm -v /disk1/liuh/qiime2:/work -it omicsclass/ampliseq-q1:v1.2 请老师帮忙解答一下,谢谢。

问题 hisat2中提示"/work/my_rnaseq/ref/Gmax_508_v4.0.fa" does not exist

查了路径,设置好了,也重新进入docker重设路径了,还是不想,一直提示不存在