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问题 jcvi安装报错

ImportError: cannot import name 'HTTPSConnection' 另外还想问一下，docker课程里面是否具备collinearscan软件的安装与使用

文章 eggNOG批量注释基因组数据库

... eggnog.db64fefa838833a6f3e220a06fb9d403cd  eggnog_proteins.dmnd 利用docker工具eggnog进行注释，以拟南芥为例： #非模式物种GO KEGG注释与富集分析 #eggnog 数据库下载之后解压，放到一个目录中 #启动镜像 #docker run --rm --cpus 8 -m 16G -it -v /share/...

问题 镜像安装，镜像安装

老师，您好！我尝试跟着教程执行docker pull omicsclass/pan-gene-family:v1.0命令行时根本下载不了镜像，请问一下您可以发一份本地版本镜像文件吗

问题 重测序

我在重测序call  SNP 的时候，为什么跑一段时间这个镜像就找不到了？但是任务和文件怎么还在更新？ [us001@omicsclass-a06  16:17:00 ~]$docker ps CONTAINER ID  IMAGE       COMMAND     CREATED     STATUS      PORTS       NAMES

问题 kaks转换报错

老师，您好！ 我目前是在docker的bio-linux里操作的，我在做aln转换axt格式时老师报错，请问如何解决。说是没权限，但是我已经再root里面给了777权限，但还是报错。

问题 镜像加速接下来怎么操作

看了docker在windows系统和mac系统中安装 - 组学大讲堂问答社区 (omicsclass.com)这个帖子，但页面不一样，不知道接下来怎么操作，求解答，感激。

问题 为什么启动不了镜像？

docker run -it -m 3G --cpus 1 --rm -v D:/reseq:/work omicsclass/reseq:v1.1 这条命令启动不了镜像这是为什么？输入进去以后就会报错invalid option type work

文章 基因家族docker 镜像使用方法

##################################################进入docker虚拟机，注意自己安装的docker版本##################################################下载基因家族分析镜像#docker pull omicsclass/gene-family:v1.0#docker desktop 进入虚拟机命令#docker run -m 3G --cpus 2 --rm -v D...

文章 6分+文章告诉你2021基因家族分析文章还好发！

...了一次重大更新！更新内容如下：1. 分析环境采用全新的docker虚拟机docker是一种更好用的虚拟机工具，其体积小巧，可以在任何操作系统中安装运行，使用更加方便。同时，组学大讲堂不再更新基于vbox的biolinux系统。但为方便刚...

问题 运行ggtree.r报错permission denied!

在gwas的docker中运行进化树作图脚本ggtree.r报错-Permission denied

问题 sqlite数据库 配置

老师好，如果使用sqlite数据库，一开始进入注释容器的时候，怎么配置呢？  需要 link 吗 docker run -it --rm --name annotation -v /home/super/Desktop/:/work --link "mysql_pasa:mysql" omicsclass/genome-annotation

问题 想要bsa分析和绘图的脚本

两个亲本两个子代，我想自己从vcf文件开始分析，之前报了那个49.9的bsa课程，但主要是从docker中操作，我想用R进行分析，我想咨询怎么才能得到那个脚本，很喜欢做出来的那个图。。。。

问题 xpclr 软件不能运行

...s002@omicsclass-a02  12:28:21 ~/work/pop_cucu_demo/05.select_sweep/xpclr]$docker imagesREPOSITORY                          TAG         IMAGE ID      CREATED        SIZElocalhost/omicsclass/pop-evol-gwas  v2.0        efcdf45e89d0  7 months ago ...

问题 动植物基因组组装

...序列的组装，sh中设定scripts的目录在/work/scripts/中，但我docker pull的基因组组装镜像中没有这个目录，目录结构如下/shar/work/biosoft.  没有scripts这个目录。导致流程中提到的很多脚本无法找到，请您们确认下，谢谢！

问题 重复序列注释的问题

求助老师，在用docker镜像进行重复序列注释中，出现如下错误，请问老师该怎么解决： Reading liftover chains Couldn't open /work/data/genome.chain , No such file or directory 另：在一次全部运行 01.Repeat.sh时，如果中间出现报错，是要重新运...