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问题 扩增子分析 :qiime2分析-多样性分析alpha-beta-差异比较等 课程中的问题

#添加分类信息时报错 这是用qiime2分析完数据后,再利用qiime分析时候报错 #自己用服务器进入的ampliseq-q1:v1.2使用的命令:docker run --rm -v /disk1/liuh/qiime2:/work -it omicsclass/ampliseq-q1:v1.2 请老师帮忙解答一下,谢谢。

问题 hisat2中提示"/work/my_rnaseq/ref/Gmax_508_v4.0.fa" does not exist

查了路径,设置好了,也重新进入docker重设路径了,还是不想,一直提示不存在

文章 组学大讲堂视频课程

...步。 生物信息入门到精通必修基础课:linux系统使用、docker搭建生物信息分析环境、实验室linux生信分析平台搭建、linux命令处理生物大数据、perl入门到精通、perl语言高级、R语言画图、R语言快速入门与提高、python语言入门到精...

文章 2023年秋季线下/直播培训火热报名中!

... ① 课程针对0基础学员设计,半自动化分析; ② 采用docker虚拟机技术,不同操作系统保持一致分析步骤; ③ 云服务器上教学,避免电脑性能不足;④ 问答社区解决售后技术问题。 秋季线下培训班详情: 一、“群体重测...

文章 2024最新版《基因家族分析实操》直播培训开始报名了!

...服务器分析,自己电脑仍可正常办公; ③ 采用先进的docker虚拟机去教学(国内首创),无需担心安装生信软件、配置分析环境等难题,不同操作系统下分析步骤基本一致,真正的能学会,能用起来; ④ 内容丰富,课程内容...

文章 最新2区SCI思路解析—杨树TPS/TPP基因家族的系统分析

...Linux系统或者连接远程云服务器的方式,而是采用先进的docker虚拟机去教学(国内首创),docker具有强大的可移植性,你可以在任何一台Windows电脑、苹果电脑、服务器上轻松的进行课上所学操作,而不用担心安装生信软件、配置...

问题 Linux服务器上,运行提取结构域的脚本的时候,出现未安装Bio/SeqIO.pm in @INC的错误,请问如何解决

Linux服务器上,运行提取结构域的脚本的时候,出现未安装Bio/SeqIO.pm in @INC的错误,请问如何解决,这个问题之前有提过,但是没有人回答,有人只是指出可以安装docker,但是需要root用户安装,没有root权限的用户怎么办

文章 QIIME1格式转换

...式同otu_table后跟物种注释) 2.转换成biom格式文件:(docker上下载QIIME1镜像) biom convert -i mat.txt -o otu_table.from_txt.biom --table-type="OTU table" --process-obs-metadata taxonomy --to-hdf5 3.在运用QIIME1脚本进行分类: 不同水平下相对丰度文件:...

问题 基因组注释 ,seqclean软件报错

...在做基因组注释时,PASA_assembly中,seqclean报错,使用的是docker的镜像,已添加export USER='me'   报错信息如下: /work/zhushi/04.PASA_assembly/UniVec seqclean running options:  seqclean all_transcripts.fasta -c 10 -n 10000 -v ./UniVec  Standard log file: seqcl_...

文章 紧扣2025国自然热点--10+研究培训总有你需要的!

... ①课程针对0基础学员设计,半自动化分析; ②采用docker虚拟机技术,不同操作系统保持一致分析步骤; ③云服务器上教学,避免电脑性能不足; ④提供回放视频,两年内可反复学习; ⑤问答社区解决售后技术问题。 报...

问题 老师,在使用 perl ../script/get_fa_by_id.pl进行基因家族成员顺势作用原件分析与展示时程序报killed

这里用的是玉米基因组2.1G, 开始搭建镜像时docker run -m 10G --cpus 2 --rm -v C:/gene-family:/work -it omicsclass/gene-family:v1.0.1 给了10G, 然后不管是使用perl ../script/get_promoter.pl ../Arabidopsis_thaliana.TAIR10.dna.toplevel.fa mrna_location.txt promoter.fa还是拆...

问题 老师,您好,我按照课程安装doekcr,下载了群体遗传学的镜像,在启动镜像的时候总是显示错误,请问老师该如何解决呢?

...下载了群体遗传学的镜像,在启动镜像的时候执行指令:docker run --rm -it -m 4G --cpus 1 -v /home/share/pop-evol:work omicsclass/pop-evol-gwas:latest 总是显示Error response from daemon:failed to create task for container: failed to create shim task: OCI runtime create fa...

问题 Raw-mode is unavailable courtesy of Hyper-V. (VERR_SUPDRV_NO_RAW_MODE_HYPER_V_ROOT).

尝试安装过docker desktop,导致toolbox无法启动 Windows10无法完全关闭Hyper-V导致VirtualBox 虚拟机无法启动 Raw-mode is unavailable courtesy of Hyper-V. (VERR_SUPDRV_NO_RAW_MODE_HYPER_V_ROOT). 返回 代码:E_FAIL (0x80004005)组件:ConsoleWrap界面:IConsole {872da645-4a...

文章 biolinux共享目录文件夹建立及注意事项

...大讲堂不再支持vbox中的biolinux,转向用更好的虚拟机工具Docker,学习安装使用课程见: https://zzw.xet.tech/s/3Rcvt0   更多生物信息课程: 1. 文章越来越难发?是你没发现新思路,基因家族分析发2-4分文章简单快速,学习链接...

文章 组学大讲堂周年庆特大优惠---VIP最高返礼6800元!!

...答疑,专业讲师指导,学习没烦恼。配套云服务器,加持docker镜像,学完就能练,完全不卡顿。 学习不断层,成长不停歇730天内新增课程免费学,紧跟最新科研潮流,成果文章发不停!730天内,组学大讲堂所有直播课程免费学...