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摘要:为了探究驱动植物根部微生物多样性和植物适应性影响因素,作者用三年时间在欧洲17个地方监测拟南芥种群和其共生草的根系微生物菌群。观察到不同地点的土壤微生物有显著的结构变化,而不同...
微生物生态研究中常用数据库简介
距离矩阵差别:jaccard bray-curtis 欧式距离 unifrac(weighted/unweigted)
PCA pcoa分析取舍
《Nature》发文证明了某种机器学习算法能够对微生物群落样本进行有效且准确的分类,并且可以找出能够区分组间差异的关键成分(OTU或物种)。本文介绍了该算法的实现形式和应用。
Beta多样性用于不同生态系统之间多样性的比较,也就是样品间的差异,详细介绍beta多样性结果内容及意义。