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关于基因芯片affy包rma标准化

• geo数据芯片
• GEO

• fartjet 2019-08-08 21:30:05

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R下载GEO数据没有显示GSM1625995 = col_double()

• GEO
• R

• Gordon 2019-08-01 09:52:12

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GEO数据集expression matrix表达量很低，很多是负数，单通道芯片

• GEO

• fartjet 2019-07-31 16:18:07

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老师，我想问一下课程里面有个课程是可以处理双通道芯片的，它是具体处理出来是怎么样的呢，是知道了每个处理的表达量吗

• GEO

• 小不点 2019-07-06 09:57:33

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老师您好，我想问一下在GEO中的双通道芯片里面可以下载到的series_matrix.txt文件中的数值是有正负求的，并且数值基本没有超过10的，是不是说明这些值已经是处理和对照的比值然后取了log2所得到的呢，如果是的话我是不是可以直接通过观察这个文件里面的值就可以看到我所研究的基因有没有发生上调和下调，然后可以直接用这个值来做我的基因家族成员表达的热图吗

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• 小不点 2019-07-04 11:34:50

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GEO双通道芯片数据

• GEO

• 宋浩 2019-07-03 19:45:30

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getGEO函数不能下载，提示Error in open.connection(x, "rb") : cannot open the connection，谢谢！

• GEO

• 荣 2019-06-17 13:13:42

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鲁棒性检验代码

• TCGA
• GEO
• R

• 王宇涛 2019-04-30 00:20:30

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老师麻烦您看看这是我在GEO数据库里找到的芯片数据，没有看懂样本后缀KE1,KE2,B1,B2代表的是什么意思，按道理来说后缀应该都是rep1,rep2,rep3这样子的重复才对啊，这里的没看懂是什么重复

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• 小不点 2019-04-21 17:02:15

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转录组数据上传GEO数据库

• GEO

• 追梦 2019-04-16 19:12:10

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转录组数据上传GEO

• GEO

• 毛栗小懒彤 2019-04-15 10:20:51

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老师，麻烦您看一下我下载了这种series_matrix.txt 文件后续可以怎么分析，找到我自己一些感兴趣基因的表达量绘制热图，看这个文件像是双通道芯片对吗

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• 小不点 2019-03-28 10:54:52

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老师您好，我想问一下关于双通道芯片转录组数据分析的相关课程和资料有吗？因为我在GEO数据库里找到的我需要的转录组数据是双通道芯片的

• 转录组
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• 小不点 2019-03-20 09:39:46

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老师，我想问一下GEO数据挖掘可以做植物的吗？因为我发现这个都做的是人体疾病的，植物的一般都是去对应植物的基因组数据库里去下载，对吗？

• GEO

• 小不点 2019-03-15 17:15:19

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GEO网站提供数据标准化结果负值

• GEO
• 标准化数据
• 负值

•  zxlll 2019-02-25 14:53:21