TCGAbiolinks

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老师 你好，我通过Git bash利用代码 tcga_gene_exp_download下载数据提示terminate called after throwing an instance of 'std::bad_alloc' what(): std::bad_alloc，无法分析后续数据

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老师好，R包一直安装失败不知道怎么回事，Bioconductor上的安装出现问题，如图所示（但是加载的话不报错！），还有就是VIP还是没通过呀，我子订单也提交了

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使用R语言无法从TCGA数据库下载数据

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gdcRNADownload(project.id = 'TCGA-CHOL', + data.type = 'RNAseq', + write.manifest = FALSE, + method = 'gdc-client', + directory = rnadir)

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为什么在使用TCGAbiolinks包下载数据时会出现以下问题呢？

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请问为什么我的R怎么都下载不了TCGAbiolinks,下载到了最后总是出现这样的问题？

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R怎样读取下载好了的TCGA数据

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老师，请问sample type出现这种情况怎么解决，麻烦老师解惑一下，谢谢啦。

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用R包TCGAbiolinks下载TCGA的miRNA数据报错

  • OY_J 2020-05-12 15:47:11
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TCGAbiolinks GDCprepare使用问题 提示找不到文件？

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请教TCGA差异表达分析分组问题

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TCGAbiolinks包

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TCGA中比如说我要下病例报告，slide，还有msi怎么下载?

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TCGAbiolinks下载“Copy Number Variation”在提取矩阵时报错（在下载miRNA和甲基化数据时也遇到这个问题）， expdat变量不是SummarizedExperiment这个类型，导致assay(expdat)不能提取，请问怎么解决

  • momo 2020-03-03 00:04:53
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Error in seq.default(grps[start] + 1, grps[start + 1] - 1) : 'from' must be of length 1此外: Warning messages: 1: In file(con, "r") : InternetOpenUrl失败:’不能连接到吊销服务器，或者未能获得最终响应。' 2: In readLines(...) : 读'http://bioconductor.org/config.yaml'时最后一行未遂

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