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hmmersearch

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我使用hmmsearch时弄出来的文件是空文件夹这是为什么嘛？我下载的是hmmer3.0 windonws版

坐在蘤院看日落 2024-05-30 12:33:32

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基因家族分析--结构域在线数据库中确认

一枚安静的咸鸭蛋～ 2024-05-23 15:51:47

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请问鼠标指的那个命令如果有两个结构域是要分别进行分析吗

李 2023-11-15 16:34:58

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HMM搜素后显示No targets detected that satisfy reporting thresholds，生成的文件没有候选基因

半予 2022-07-05 20:44:01

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用hummer 的脚本（domain_xulie.pl）运行出来的保守结构域是空的，之前hummer search都很正常

impeccable 2022-04-12 16:45:44

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老师，我用hmmsearch 没搜索出结果，然后用拟南芥的query.fa和我要分析的物种cds进行blast分析，比对出来的基因只有几个，我老师说我要做的基因有200多个，完全对不上，不知道该怎么办了，请教下老师。

十一 2022-01-25 20:55:11

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命令

.Bubblehead 2021-06-21 09:50:58

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hmmsearch出现Error: Failed to open sequence file aa.fasta>uu.out for reading，如何解决呢？？

kKUI 2021-03-10 19:18:58

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用hmmer search搜索基因家族的时候，怎么也找不到结构域。怎么办，序列和代码都是对的。

浪失杂货铺 2020-10-11 20:52:13

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老师，我在做甘蔗基因家族分析，发现hmmsearch完了之后得到的序列与传统的名称不太一样，因为他染色体命名好像是1A2A3A4A,1B2B3B4B这样的

巴德 2020-06-28 21:25:48

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怎么在hmmsearch的XXX.out结果里，截取基因ID，L最后再提取序列？Linux系统下怎么编码

法图麦·大鑫 2020-04-15 23:39:26

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老师您好，我想问下如何用hmmsearch在数据库中搜索同时具有两个结构域的所有蛋白质

Jian Cheng 2020-04-12 19:45:33

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老师您好，在用pfam号进行基因家族搜索时，一次搜索得到的基因数目比文献当中报道的数目要少。是不是二次搜索建立物种特异hhm后，搜索的基因数有可能会多一点呀？

yan 2020-03-24 02:00:03