GATK - 组学大讲堂问答社区

GATK

暂无介绍

1回答

259浏览

按照您昨天提供的IndexFeatureFile 工具来构建gvcf文件索引时，依旧出现报错现象，无法索引，怎么办

啊呀。 2024-10-19 14:48:39

1回答

637浏览

用GATK call SNP时报错

甜辣辣 2024-07-17 11:29:47

1回答

738浏览

在singuarity使用gatk时调用不了HaplotypeCalle指令

233 2024-07-03 14:57:11

1回答

885浏览

GATK 报错

Elf 2024-04-03 13:17:37

1回答

1147浏览

使用GATK的GenomicsDBImport合并gvcf导入db时报错Unexpected compressed block length: 1 for /work/GATK/BN14.g.vcf.gz

薄信 2024-03-14 11:38:27

2回答

780浏览

gvcf转换成vcf

蒙头学 2024-03-13 11:07:50

1回答

961浏览

合并g.vcf

Jay 2024-03-12 19:22:08

1回答

1053浏览

合并g,vcf

Jay 2024-03-11 19:42:35

2回答

1386浏览

用samtools call出单个样本的rawvcf文件，合并之后发现samtools不像GATK的文件gvcf那样保存与参考基因组相同的位点，而是在合并之后都变成了缺失，想咨询一下samtools call出的这组数据还可以用吗，有什么办法？

东篱 2024-02-20 10:57:33

1回答

1073浏览

变异结果过滤，gatk VariantFiltration

yangxiang666 2024-01-22 10:15:09

1回答

903浏览

GATK

shidandan 2023-12-13 16:46:28

1回答

1209浏览

老师，请教一下，用gatk call g.vcf.gz格式的文件是，运行中断了，请问怎么样才能和之前跑的数据接着跑，而不是从零开始呢

红红火火 2023-10-30 15:14:43

1回答

1825浏览

合并gvcf时程序终止

诈胡 2022-08-16 10:23:40

2回答

7947浏览

合并gvcf的问题

米生花 2022-08-11 23:47:55

1回答

1762浏览

老师你好我在用gatk合并gvcf文件的时候系统提示有一个样本的gvcf文件某一行数据出现问题这种情况应该怎么解决是需要重新生成这个样本的gvcf文件吗？

St.Sky 2022-02-26 16:33:10