宏基因组 - 组学大讲堂问答社区

宏基因组

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binning 想做功能注释，但还是不知道该用哪些文件进行基因预测和功能注释？

George 2025-01-02 14:56:36

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binning物种注释的时候，gtdbtk软件和数据包已经更新，旧版的匹配不上，请问应该怎么更新一下软件，谢谢

George 2025-01-02 11:44:41

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想咨询一下，可否有contig的NR库的物种和功能注释代码和教程？

George 2025-01-02 02:39:19

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想咨询一下，宏基因组功能注释的视频中，有一步是用cds.fa文件注释物种，想咨询一下，这个物种注释出来后，应该如何计算丰度？是根据前面cds.count来计算吗，这样计算出的物种丰度可靠吗？因为有些物种可能基因很多。

George 2025-01-02 02:36:37

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请问，我弄了一个256线程，1t内存的服务器，想处理500G的宏基因组注释，大概需要跑多少天，全套下来

George 2025-01-01 07:11:32

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不知道为什么，产生不了unmap文件

George 2024-12-23 09:44:03

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想请教一下，我是基于windows+docker做的宏基因组注释，然后在去宿主这一步，卡住了不知道为啥一直不动

George 2024-12-20 19:09:02

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想要获取一下metagenomics:v1.0本地百度网盘镜像，谢谢

George 2024-12-14 12:48:36