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老师您好，针对这个问题https://www.omicsclass.com/question/7725。你们提到：你这个数据里面是不是P值有0的情况，取了对数就无穷大了，导致出问题。但是，我发现里面没有P值为0的情况，那是不是脚本gwas_manhattan_plot.r有问题呢？需要修改gwas_manhattan_plot.r脚本的什么地方才可以解决顶部只能画半圆的问题呢？还有，我发现P-Value的原始文件有NaN的情况，是什么原因呢？是否对GWAS有影响呢？

• 群体研究合辑（基因组重测序、遗传进化、GWAS、BSA）
• GWAS

• John 2025-03-18 15:15:57

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GWAS图像问题

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• John 2025-03-11 11:30:01

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R语言GAPIT跑GWAS，ERROR求解：不能有负长度矢量，万分感谢！！！

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• wangshengbnag 2024-08-26 10:02:55

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R语言GAPIT跑GWAS错误 Error in ‘[.data.frame‘(GD,,!is.na(GI.MP[,3])):选择了未定义的列

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• wangshengbnag 2024-08-26 09:58:47

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gwas

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• Jay 2024-05-21 10:37:20

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gwas分析tassel软件GUI界面PCA文件，表型，和hapmap文件合不起来

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• 李念 2024-04-20 11:43:26

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GWAS脚本中的$PATH为什么脚本运行会报错

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• Jay 2024-03-19 21:28:28

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水稻LD的衰减距离如何计算？

• 水稻LD
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• 衰减距离

• kid 2024-03-12 17:18:27

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使用gapit的五个模型Blink、GLM、MLM、MLMM、FarmCPU，跑出来的结果几乎一致，这是什么原因呢

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• Arial 2024-03-06 09:13:02

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GWAS筛选阈值设置

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• Wang J 2024-02-20 16:21:13

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为什么做gwas分析的时候，经过性状数据分析的步骤后，输出的文件种表型只剩317个，都是我的数据应该是340个左右（只是一年的数据）

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• Arial 2024-01-22 22:38:33

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GWAS假阴性过高，请问怎么解决

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• Wang J 2024-01-12 18:48:14

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GWAS课程中LD分析使用示例数据一直做不出来，检查很久都没有解决问题，麻烦老师进行解答。

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• Chen jie yang xi rêve 2023-12-01 14:09:53

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用linux系统做gwas时运行脚本报错[Thread-9] ERROR net.maizegenetics.plugindef.AbstractPlugin - 0

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• 不会三分 2023-11-30 17:23:25

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老师您好，请问一下GWAS筛选植物NPK高效因子前需要做什么准备工作

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• 是但 2023-10-17 10:46:30