GWAS

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全基因组关联分析GWAS教程中的beagle填充问题

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GWAS分析的教程中06.impute的beagle填充出现问题

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老师您好，针对这个问题https://www.omicsclass.com/question/7725。你们提到：你这个数据里面是不是P值有0的情况，取了对数就无穷大了，导致出问题。但是，我发现里面没有P值为0的情况，那是不是脚本gwas_manhattan_plot.r有问题呢？需要修改gwas_manhattan_plot.r脚本的什么地方才可以解决顶部只能画半圆的问题呢？还有，我发现P-Value的原始文件有NaN的情况，是什么原因呢？是否对GWAS有影响呢？

  • John 2025-03-18 15:15:57
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GWAS 曼哈顿 Manhattan 图像问题

  • John 2025-03-11 11:30:01
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R语言GAPIT跑GWAS，ERROR求解：不能有负长度矢量，万分感谢！！！

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R语言GAPIT跑GWAS错误 Error in ‘[.data.frame‘(GD,,!is.na(GI.MP[,3])):选择了未定义的列

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gwas

  • Jay 2024-05-21 10:37:20
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gwas分析tassel软件GUI界面PCA文件，表型，和hapmap文件合不起来

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GWAS脚本中的$PATH为什么脚本运行会报错

  • Jay 2024-03-19 21:28:28
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水稻LD的衰减距离如何计算？

  • kid 2024-03-12 17:18:27
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使用gapit的五个模型Blink、GLM、MLM、MLMM、FarmCPU，跑出来的结果几乎一致，这是什么原因呢

  • Arial 2024-03-06 09:13:02
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GWAS筛选阈值设置

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为什么做gwas分析的时候，经过性状数据分析的步骤后，输出的文件种表型只剩317个，都是我的数据应该是340个左右（只是一年的数据）

  • Arial 2024-01-22 22:38:33
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GWAS假阴性过高，请问怎么解决

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GWAS课程中LD分析使用示例数据一直做不出来，检查很久都没有解决问题，麻烦老师进行解答。

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