KaKs - 组学大讲堂问答社区

KaKs

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KAKS作图问题

树心台 2024-09-23 20:44:32

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不同物种间的同源基因对Ka/Ks计算需要用哪些文件呢

Orange_flame 2024-03-23 22:08:47

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老师您好，我想做KaKs批量计算，但是我之前下载的版本是旧版本，网课时限也到期了，script和w.sh里没有关于利用ParaAT来批量计算kaks的脚本和命令，老师您能发给我一份吗，谢谢您

陌明 2023-12-10 16:58:02

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比较基因组学鉴定出的两个物种的基因家族的基因存在共线性,如何计算它们的kaks

知行合一 2023-10-09 11:20:09

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老师您好，在KAKS分析时duplication_gene.out导出为空怎么解决呢？

siu 2022-08-13 22:12:03

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老师，我在重新描述一下问题，mascanx方法和BLAST计算KAKS时筛选到的Segmental和Tandom加倍基因对，数目不一样，是不同算法的不同结果是吗？做CIRCOS圈图时，可以用BLAST计算KAKS时筛选到的Segmental和Tandom加倍基因对来做吗？我BLAST方法筛出来的串联重复等数目更多一些。

徐渴 2020-12-29 09:57:31

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MCSCANX和KAKS计算出的共线性对数目不一致，虽然用的都是70%同源性。这合理吗？如果用KAKS计算出的基因对做circos圈图合理吗？

徐渴 2020-12-28 13:13:57

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计算复制基因kaks not equal

勇敢的心 2020-10-17 21:15:58

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两个基因是片段重复基因对，序列完全一致，但是KA/KS值为NA

小明 2020-10-15 16:05:59

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KAKS计算

荣 2020-08-21 01:28:20

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kaks计算

荣 2020-08-12 10:37:59

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找不到kaks分析的文件

Cynthia 2020-05-19 19:50:47

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关于KA/KS的计算和种内圈图

kaikai 2020-04-15 16:41:39

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KAKS格式转换

Li 2020-03-02 19:20:37

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如何手动将aln转成axt？

麓鲈山僧 2020-01-04 17:32:39