叶绿体或线粒体基因组重复序列分类及鉴定

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• 星莓 发布于 2023-11-29 11:45

叶绿体/线粒体基因组的串联重复序列鉴定——TRF

TRF网站是基因组注释中常用于检测序列中串联重复序列的软件，无需安装，使用简单方便，同样适用于细胞器基因组的串联重复序列鉴定。 https://tandem.bu.edu/trf/trf.html

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• 星莓 发布于 2023-11-29 10:51

《叶绿体基因组分析实操》课程更新

​叶绿体/质体是植物的重要细胞器，具有独立的基因组。自植物叶绿体基因组被发现以来，被广泛应用于植物系统进化关系研究、物种鉴定、叶绿体基因工程等方面。 同时叶绿体基因组分析作为一个优秀...

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• 星莓 发布于 2023-10-12 15:42

叶绿体/线粒体散在重复序列注释——REPuter

REPuter可注释叶绿体重复序列，包括4种类型，Forward（F）, Reverse (R), Complement (C), Palindromic (P)。 REPuter 是可在线注释， 详情可参考文献  REPuter: the manifold applications of...

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• 星莓 发布于 2023-10-11 15:30

叶绿体基因组四个区边界作图——irscope：本地化及使用教程（2023.02）

大部分植物的叶绿体基因组具有典型的四分体结构，即由LSC、SSC以及一对IR区域构成，IR和SSC区域的收缩与扩张是常见的进化事件。通过irscope工具可以将多个物种叶绿体的区域边界进行可视化对比...

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• 星莓 发布于 2023-02-15 15:53