暂无介绍
01. samtools提取bam文件中某部分染色体相关信息 samtools view -b -h XX.bam chr1 chr4 >XX2.bam 02. samtools构建bam文件的索引 samtools index XX2.bam
筛选出能比对到参考序列的reads,形成新的fastq文件
Samtools截取基因组序列(Docker篇)
组学大讲堂samtools工具docker镜像使用方法:
利用samtools截取指定位置的序列
samtools过滤多重比对reads
samtools使用
linux下samtools安装指南
samtools tview 可视化查看比对结果
若想要从sam或bam文件中提取指定区域内的reads,可以使用samtools和bedtools来实现。 首先准备一个区域信息文件。region.bed #第一列为染色体ID,第二三列分别为起始终止位置 ...
如何快速知道你的多个序列的长度呢?这里还是分享一个虚拟机的bio-linux的工具,samtools。命令行格式:samtools faidx xulie.fa(你的序列文件)结果会生成一个 xulie.fa.fai文件,也是就是在...