NCBI - 组学大讲堂问答社区

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探索基因大数据的利器——SRA Explorer

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安生水发布于 2024-05-08 15:19

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NCBI 基因组文件下载——datasets

datasets和dataformat是NCBI的命令行（Command line tools）工具，datasets可以下载ncbi上的生物数据，dataformat可以将metadata数据从json格式转化成其他格式类型。 1. 下载工具 curl -o d...

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Ti Amo 发布于 2024-04-24 16:52

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使用NCBI——Batch Entrez批量下载蛋白序列

使用NCBI自带的工具实现蛋白序列的批量下载

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每天学习一点点发布于 2023-11-01 13:53

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NCBI的SRA Lite和SRA Normalized数据有什么区别

有时候我们从NCBI下载SRA文件时会发现，会有SRA Lite和SRA Normalized两种类型的数据，前者后缀是.sralite，其文件大小也比原始的SRA文件要小。这两种数据的区别是什么呢？

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星莓发布于 2023-06-08 14:29

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NCBI下载SRR并转换为fastq文件

想下载该篇文献中某一样品的fastq原始数据，看了一些下载教程，方法各异，看完思路还是不清晰，以下记录我的操作步骤，仅供参考

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星莓发布于 2022-12-09 11:56

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NCBI下载物种叶绿体或线粒体基因组fasta，gff3，gtf，gb文件等

NCBI下载物种叶绿体或线粒体基因组fasta，gff3，gtf，gb文件，以及获得细胞器基因组的全部基因名称

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星莓发布于 2022-12-05 14:58

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NCBI、ENA高通量测序数据下载-fastq数据

NCBI高通量测序数据下载-SRA数据库

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omicsgene 发布于 2022-08-15 09:49

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ascp 高速下载NCBI各种数据库中的数据（SRA NR NT 分类数据库，）

ascp快速下载NCBI各种数据库种的数据

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omicsgene 发布于 2022-01-24 13:27

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NCBI 蛋白数据库分库

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omicsgene 发布于 2021-12-13 18:40

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fastq序列做NR库比对

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omicsgene 发布于 2021-12-07 15:53

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如何使用NCBI进行blast比对

NCBI的blast功能你了解多少？

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生信老顽童发布于 2020-03-20 16:26

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一个自动获取最新文献的方法！

NCBI小技巧

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生信老顽童发布于 2020-03-07 15:25

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NCBI-SRA数据下载的3种方法

SRA 数据库，为Sequence Read Archive 的缩写。主要存储高通量测序的原始数据，来自四个测序平台，分别为：Roche_LS454，Illumina，ABI_SOLID和HELICOS。

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安生水发布于 2019-08-08 14:48

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分离NR NT库，快速blast本地比对同源注释基因

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omicsgene 发布于 2019-06-14 15:24

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NCBI 中如何将GI号转换成Accession version

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omicsgene 发布于 2019-05-28 17:54